More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1646 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  100 
 
 
104 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  100 
 
 
104 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  99.04 
 
 
104 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  98.08 
 
 
104 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  99.03 
 
 
103 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  67.96 
 
 
104 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  66.99 
 
 
104 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  66.99 
 
 
104 aa  161  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.99 
 
 
104 aa  161  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.99 
 
 
104 aa  161  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.99 
 
 
104 aa  161  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  66.99 
 
 
104 aa  161  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.99 
 
 
104 aa  161  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  66.99 
 
 
104 aa  161  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  45.95 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  47.89 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  39.05 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  43.66 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  35.59 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  41.25 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  38.46 
 
 
116 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  42.19 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  39.19 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  37.18 
 
 
116 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  38.24 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  37.84 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  37.84 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38.03 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  36.76 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  38.54 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.28 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.75 
 
 
568 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  37.84 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.59 
 
 
393 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  36.62 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  27.43 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  38.57 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  41.89 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1706  Rhodanese domain protein  32.86 
 
 
190 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0369363  normal  0.872619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.47 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  32.86 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 
123 aa  57.4  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  33.72 
 
 
170 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.78 
 
 
389 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0689  rhodanese-like domain-containing protein  36.49 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.152263  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0675  rhodanese-like domain-containing protein  36.49 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.852423  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  37.14 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0873  rhodanese-like domain protein  36.49 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000378208 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  36.11 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.46 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0741  rhodanese-like domain-containing protein  37.84 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.138504  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  43.84 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  37.14 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0779  rhodanese-like domain-containing protein  37.84 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  31.43 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  40 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.62 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  36.07 
 
 
201 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  38.57 
 
 
279 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  33.8 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  31.43 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40 
 
 
277 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  35.71 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
124 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  40.54 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  34.29 
 
 
132 aa  53.9  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1308  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
271 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.197822  normal  0.0310663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2883  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
172 aa  53.9  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8077  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21670  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.36 
 
 
197 aa  53.9  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  32.89 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  35.14 
 
 
119 aa  53.5  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  32.86 
 
 
189 aa  53.9  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.18 
 
 
388 aa  53.5  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  34.72 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 
125 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0839  rhodanese-like domain-containing protein  38.81 
 
 
235 aa  53.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5692  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
221 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5313  rhodanese-like protein  35.14 
 
 
221 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  32.89 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  33.8 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5402  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
221 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.172427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>