More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0262 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 145 aa  292  8e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  59.82 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  50.6 
 
 		 129 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  52.44 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  51.22 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  49.38 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  51.22 
 
 		 138 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  51.22 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  35.38 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  48.65 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  39.13 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  51.22 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  51.22 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  51.22 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  42.17 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  41.9 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  41.9 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  48.75 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1713  putative lipoprotein  38.52 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  30.5 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2615  Rhodanese domain protein  30.14 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  45.12 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  45 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  41.67 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06440  lipoprotein, putative  34.07 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  42.68 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4870  rhodanese domain-containing protein  38.78 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00622661  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  44.16 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  44.16 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  44.16 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  44.16 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  44.16 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  44.16 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  44.16 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  43.75 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  44.16 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  44.16 
 
 		 104 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf241  rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 		 685 aa  72.4  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  45.57 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.86 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.28 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  36.71 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3133  rhodanese-like protein  39.2 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  35.09 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  43.9 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  34.82 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1059  Rhodanese domain protein  38.75 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  47.13 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  40.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  33.58 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  40.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  40.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  40.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  37.84 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  33.58 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  40.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  40.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  40.43 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  45.68 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  39.02 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  47.5 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1915  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.697254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  37.04 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  41.33 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  43.53 
 
 		 361 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0870  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  30.09 
 
 		 136 aa  67  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0063  Rhodanese domain protein  45.45 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0402698 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  40.48 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  44.33 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  42.5 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  33.03 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  42.5 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  38.71 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  33.63 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  47.95 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  39.78 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2054  rhodanese domain-containing protein  40.45 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  33.78 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  40.79 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  37.36 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.56 
 
 		 566 aa  62.8  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  41.03 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>