More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2076 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  100 
 
 
126 aa  258  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  65.6 
 
 
131 aa  184  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  65.04 
 
 
129 aa  176  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  60 
 
 
130 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  57.6 
 
 
131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  57.26 
 
 
131 aa  167  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  56.8 
 
 
131 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  56.8 
 
 
130 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  49.18 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  42.74 
 
 
130 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  41.73 
 
 
134 aa  107  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  43.55 
 
 
130 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 
129 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  43.44 
 
 
128 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  46.36 
 
 
136 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  43.09 
 
 
128 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  40.16 
 
 
130 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  38.76 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 
136 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  38.4 
 
 
137 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  45.9 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  39.02 
 
 
137 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  37.4 
 
 
130 aa  94.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  36.15 
 
 
141 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  36 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 
138 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  35.16 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  35.77 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  43.48 
 
 
133 aa  84.3  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  34.96 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  35.59 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  34.38 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.5 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  46.24 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  29.84 
 
 
131 aa  77  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  39.47 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  39.47 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  35.25 
 
 
323 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.19 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  33.06 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  35.77 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.21 
 
 
388 aa  70.9  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  38.02 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  32 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0847  Rhodanese domain protein  39.06 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  36.11 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 
138 aa  67  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  38.89 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.5 
 
 
389 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  30.65 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  31.36 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  37 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.61 
 
 
480 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
131 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  32.32 
 
 
98 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  33.04 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.04 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  31.93 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  37.6 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  29.41 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  35.65 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  33.77 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.35 
 
 
361 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.82 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  35.54 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  35.58 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  34.17 
 
 
438 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  31.09 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  32.79 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  27.83 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  36.27 
 
 
461 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 
656 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  33.63 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 
119 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  38.32 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  37.65 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  33.03 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  34.95 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  34.95 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  34.95 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  34.95 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  34.95 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  34.95 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>