More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1862 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 161 aa  330  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  79.08 
 
 		 159 aa  255  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  70.51 
 
 		 158 aa  237  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  71.9 
 
 		 155 aa  234  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  62.99 
 
 		 155 aa  220  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  67.33 
 
 		 157 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  61.94 
 
 		 157 aa  200  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  51.63 
 
 		 153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  41.13 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 136 aa  94.4  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  40 
 
 		 128 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  30.4 
 
 		 137 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.59 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  35.04 
 
 		 123 aa  77  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  39.84 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  34.19 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  33.85 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  45.35 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  37.29 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.51 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  34.86 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  35.65 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  34.55 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.63 
 
 		 361 aa  67.4  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  33.63 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  24.79 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.16 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.41 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  29.25 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1911  rhodanese domain-containing protein  34.26 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  30.17 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  34.19 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  30.33 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.78 
 
 		 189 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.31 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  37.5 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0838  aminotransferase, class V  36.63 
 
 		 778 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0677783  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  31.15 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  31.97 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 		 113 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  30.08 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  35.92 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  36.56 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.41 
 
 		 568 aa  58.9  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  27.42 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  34.95 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  34.41 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.64 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  35.11 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  32.73 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1271  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  33.63 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0465  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.210477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  28.69 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  29.51 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0470  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.571299  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  35.87 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0436  rhodanese-like protein  34.51 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  32.41 
 
 		 455 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  33.63 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13230  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.84 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.677298 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  26.96 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2037  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00546701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2851  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.131553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.02 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  33.7 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.53 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  37.76 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  26.67 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.67 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>