More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1680 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
154 aa  305  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  59.15 
 
 
153 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  49.28 
 
 
157 aa  133  9e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  50 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  49.21 
 
 
157 aa  131  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  44.68 
 
 
161 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  50.4 
 
 
155 aa  124  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  45.26 
 
 
159 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  50.79 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  49.57 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  44.54 
 
 
128 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  44.54 
 
 
128 aa  100  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  43.8 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  43.85 
 
 
140 aa  97.4  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  45.76 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  31.3 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.51 
 
 
120 aa  77  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  40.71 
 
 
116 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.48 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  42.64 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  38.02 
 
 
119 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 
323 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  38.02 
 
 
119 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  38.02 
 
 
119 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  38.02 
 
 
119 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  29.57 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  37.19 
 
 
361 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  39.52 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  38.4 
 
 
194 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2309  metallo-beta-lactamase family protein  35.78 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  38.71 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.88 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  36.92 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37.61 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  37.1 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
186 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  35.16 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  34.33 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  29.27 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  40.37 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.5 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  32.33 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  39.13 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  36.89 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.27 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.39 
 
 
395 aa  65.1  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  31.63 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  33.83 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  40.48 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  41.35 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4423  rhodanese-like protein  41.88 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300405 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.69 
 
 
346 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4024  rhodanese domain-containing protein  34.4 
 
 
225 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.125541  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1829  rhodanese domain-containing protein  34.4 
 
 
225 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  30.88 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.8 
 
 
395 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  33.06 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.6 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  37.6 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  37.38 
 
 
198 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.84 
 
 
393 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  37.96 
 
 
711 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  31.63 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0093  Rhodanese domain protein  43.82 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  35.71 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.13 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  36.52 
 
 
119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  40.52 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  40.78 
 
 
711 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.9 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.23 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  29.75 
 
 
167 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  33.59 
 
 
131 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  35.19 
 
 
201 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.59 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  43.16 
 
 
131 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0984  rhodanese domain-containing protein  35.2 
 
 
192 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  29.46 
 
 
127 aa  60.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 
145 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1184  Rhodanese domain protein  32.09 
 
 
194 aa  60.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  38.53 
 
 
106 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  27.78 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  36.8 
 
 
389 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  35.24 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>