More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0333 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
126 aa  260  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  69.84 
 
 
126 aa  186  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  66.67 
 
 
126 aa  177  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  42.11 
 
 
361 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.75 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.16 
 
 
132 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  41.53 
 
 
119 aa  89.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  41.6 
 
 
125 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  40 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.59 
 
 
389 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40.94 
 
 
131 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  43.44 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  37.27 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  36.36 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  39.17 
 
 
130 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  38.21 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  39.34 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  36.36 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  40.32 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  39.42 
 
 
116 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  36.13 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.34 
 
 
393 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.38 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  36.89 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  46.24 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  40.46 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  39.36 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  36.75 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  38.33 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.67 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  35.65 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  39.69 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  33.9 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  30.77 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  37.19 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 
128 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  40.17 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  32.5 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  32.77 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  38.02 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  32 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  35.61 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.97 
 
 
480 aa  70.5  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.45 
 
 
346 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  36.36 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  35.63 
 
 
99 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  35.63 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  37.82 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  37.29 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  33.63 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  35.54 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  32.46 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  35.9 
 
 
121 aa  67  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
119 aa  67  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  35.66 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  31.86 
 
 
119 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  38.02 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2263  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1238  hypothetical protein  33.91 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.950013  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  31.93 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  36.73 
 
 
479 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.54 
 
 
392 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  36.78 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  35.96 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  33.63 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  35.96 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  36.46 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  35.66 
 
 
141 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  34.48 
 
 
119 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  38.75 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.26 
 
 
480 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  32.71 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  28.21 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  27.59 
 
 
354 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  36.13 
 
 
438 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  38.55 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
113 aa  62  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  40.31 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  33.71 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>