More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2737 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  100 
 
 
136 aa  277  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  61.94 
 
 
137 aa  184  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  47.15 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  47.15 
 
 
128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  47.83 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  49.57 
 
 
154 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  41.98 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  45.38 
 
 
126 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  42.15 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  40 
 
 
155 aa  98.6  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  43.59 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  40.16 
 
 
158 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.6 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  37.4 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  43.65 
 
 
119 aa  91.3  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  38.66 
 
 
155 aa  89.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  36.92 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  39.67 
 
 
129 aa  87  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.79 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.89 
 
 
120 aa  84.3  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  44.17 
 
 
131 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  44.17 
 
 
131 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  39.83 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  32.54 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  37.5 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  35.2 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  38.66 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.43 
 
 
361 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  31.75 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  43.33 
 
 
131 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.65 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  37.82 
 
 
131 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  39.67 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  35.07 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.2 
 
 
389 aa  77.8  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  36.51 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  40.59 
 
 
389 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  39.67 
 
 
130 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  36.75 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.24 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.51 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
113 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  35.25 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  38.46 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  37.27 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  35.64 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  36.75 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  34.71 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  36.07 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.66 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.17 
 
 
386 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  32.5 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.5 
 
 
393 aa  73.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.2 
 
 
395 aa  73.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  41.12 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.38 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.59 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  36.67 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  31.93 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.72 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  34.71 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  39.66 
 
 
128 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.61 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.61 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  40.22 
 
 
711 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  35.77 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  33.09 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 
278 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  34.17 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  37.07 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.07 
 
 
379 aa  70.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  39.42 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  39.25 
 
 
99 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  35.56 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  32.61 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  34.43 
 
 
116 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.5 
 
 
392 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  35.09 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  33.66 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  35 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.07 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  36.26 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.5 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.8 
 
 
354 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  35.9 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  33.06 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  37.76 
 
 
390 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.27 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  40 
 
 
377 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  35.83 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  31.4 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>