More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2887 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  100 
 
 		 119 aa  246  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  81.51 
 
 		 119 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  78.81 
 
 		 119 aa  201  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  75.63 
 
 		 119 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  75.63 
 
 		 119 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  75.63 
 
 		 119 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  75.63 
 
 		 119 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  70.59 
 
 		 119 aa  186  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  72.27 
 
 		 119 aa  184  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  71.43 
 
 		 119 aa  181  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  70.59 
 
 		 119 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  69.75 
 
 		 119 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  64.71 
 
 		 119 aa  157  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  53.98 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  44.26 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  43.44 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  42.15 
 
 		 123 aa  98.2  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  45.79 
 
 		 123 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  41.32 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  42.2 
 
 		 116 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.82 
 
 		 388 aa  80.9  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  38.94 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 389 aa  77.4  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  33.6 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  35.2 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  38.79 
 
 		 323 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  41.86 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 361 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.74 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  38.26 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  38.26 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  38.04 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 136 aa  66.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  45.57 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  38.84 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.61 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  39.53 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  33.63 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  39.53 
 
 		 99 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  43.04 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  34.15 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.46 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  28.45 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  31.97 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.51 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  36.21 
 
 		 438 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  30.47 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.35 
 
 		 378 aa  60.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  29.69 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 		 470 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  37.63 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  38.82 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  35.43 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  35.42 
 
 		 469 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  32.76 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.14 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  31.06 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  34.94 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36.26 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  39.47 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  37.65 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  37.65 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.65 
 
 		 379 aa  57.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.65 
 
 		 379 aa  57.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  28.69 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.05 
 
 		 478 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  38.55 
 
 		 478 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.05 
 
 		 484 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  35.05 
 
 		 484 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.05 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  35.05 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  32.67 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  35.05 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.37 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.18 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  40.96 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  31.67 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  36.05 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.35 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>