More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1981 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  100 
 
 		 140 aa  291  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  50.41 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  50.41 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  48.41 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  47.83 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  44.25 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  41.13 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  42.37 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  44.35 
 
 		 157 aa  96.7  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  39.82 
 
 		 157 aa  93.2  9e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  45.3 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 155 aa  87.4  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  35.83 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  39.52 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  43.85 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  44.83 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  37.9 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  38.33 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  46.39 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  42.62 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  35 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  42.39 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.48 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.62 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  37.39 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.7 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  39.42 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  39.17 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  39.02 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  35.07 
 
 		 323 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  40.18 
 
 		 279 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  38.33 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  41.53 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  38.1 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  42.86 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  41.94 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  40.34 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  44.32 
 
 		 284 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  33.94 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.94 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35.77 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.69 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35.71 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  30.65 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  41.05 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  45.16 
 
 		 346 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00900  Rhodanese-related sulfurtransferase  40.95 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  38.02 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.15 
 
 		 136 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.07 
 
 		 386 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  44.44 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  35.09 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  38.1 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  33.08 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  34.45 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.83 
 
 		 361 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  43.82 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.74 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.75 
 
 		 393 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.14 
 
 		 392 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  33.06 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  40.21 
 
 		 103 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  37.37 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.48 
 
 		 390 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  42.53 
 
 		 277 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.84 
 
 		 395 aa  68.2  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.55 
 
 		 390 aa  67.4  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  32.06 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  38.02 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  39.45 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  39.8 
 
 		 471 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.56 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  37.62 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  37.62 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  27.87 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>