More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2188 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  100 
 
 		 119 aa  246  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  81.51 
 
 		 119 aa  210  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  74.36 
 
 		 119 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  73.95 
 
 		 119 aa  190  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  72.27 
 
 		 119 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  72.27 
 
 		 119 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  72.27 
 
 		 119 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  70.59 
 
 		 119 aa  190  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  72.27 
 
 		 119 aa  190  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  66.39 
 
 		 119 aa  176  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  66.39 
 
 		 119 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  65.55 
 
 		 119 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  63.87 
 
 		 119 aa  163  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  49.18 
 
 		 125 aa  124  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  41.8 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  40.98 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  45.87 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  40.83 
 
 		 123 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.4 
 
 		 388 aa  87.8  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  53.95 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.27 
 
 		 389 aa  80.5  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.96 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  38.28 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 323 aa  73.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  39.25 
 
 		 361 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  36.43 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  38.39 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.83 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  44.32 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.74 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  34.91 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  39.78 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  33.6 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  39.53 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  32.2 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  40.86 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  38.39 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  44.44 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.46 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  38.68 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  38.68 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  36.14 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  37.74 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.58 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  32.28 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  36.28 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  42.11 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  43.02 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  37.35 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  39.76 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  38.04 
 
 		 469 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  31.5 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  36.14 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  34.82 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  36.9 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.1 
 
 		 379 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  38.83 
 
 		 377 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.1 
 
 		 379 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  37.97 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 		 380 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 		 470 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.25 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  32.43 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  38.1 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  31.15 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  37 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2558  rhodanese-like domain protein  40.2 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.029677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2188  Rhodanese domain protein  40.2 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0415469  hitchhiker  0.000000235552 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  38.66 
 
 		 438 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.17 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  36.56 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  36 
 
 		 484 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  36 
 
 		 478 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  36 
 
 		 478 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  36 
 
 		 484 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  36 
 
 		 478 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  36.08 
 
 		 466 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  36.9 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 476 aa  57.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 480 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  34.17 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  38.1 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 114 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>