More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3836 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  100 
 
 		 140 aa  291  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  80.71 
 
 		 140 aa  238  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  78.1 
 
 		 138 aa  224  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  59.85 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  51.94 
 
 		 134 aa  151  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  50.39 
 
 		 136 aa  146  8e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  52.76 
 
 		 136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  54.26 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  51.82 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  52.38 
 
 		 129 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  48.53 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  51.59 
 
 		 137 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  51.28 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  51.16 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  47.66 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  49.18 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  46.4 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  48.8 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  44.72 
 
 		 127 aa  115  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  45.74 
 
 		 130 aa  114  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  47.2 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  47.06 
 
 		 128 aa  105  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  54.55 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  41.09 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  41.13 
 
 		 125 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.51 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  36.51 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  36.07 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  34.96 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  42.39 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  35.25 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  36.8 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 361 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  33.88 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  32.54 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  33.6 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  50 
 
 		 71 aa  75.5  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  32.03 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  35.29 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  41.8 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  34.43 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  32.54 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  29.51 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  34.13 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  34.13 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  38.3 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  34.15 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.78 
 
 		 389 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  28.69 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.9 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  31.67 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.91 
 
 		 393 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  35.04 
 
 		 345 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  37.3 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  36.19 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  30.77 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  35.25 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 		 323 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  31.75 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.75 
 
 		 346 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  30.16 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  31.2 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  32.12 
 
 		 154 aa  62  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  32.23 
 
 		 389 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  30.97 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  34.29 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  31.67 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  35.4 
 
 		 294 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  36.96 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  34.26 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  34.69 
 
 		 346 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  32.67 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  34.17 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  29.51 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  36.67 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  36.67 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  34 
 
 		 346 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1201  rhodanese domain-containing protein  29.27 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.069675  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.65 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  32.17 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>