More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1387 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 119 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  99.16 
 
 		 119 aa  243  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  96.64 
 
 		 119 aa  239  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  80.67 
 
 		 119 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  80.67 
 
 		 119 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  80.67 
 
 		 119 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  80.67 
 
 		 119 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  71.43 
 
 		 119 aa  181  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  66.39 
 
 		 119 aa  176  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  65.25 
 
 		 119 aa  166  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  67.23 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  63.87 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  61.34 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  49.56 
 
 		 125 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  41.67 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  40.83 
 
 		 124 aa  110  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  42.06 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  38.66 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  38.66 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.25 
 
 		 388 aa  84.3  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.71 
 
 		 389 aa  83.6  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  38.6 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  37.1 
 
 		 323 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 393 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  37.17 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  43.02 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.77 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.87 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  39.53 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  35.58 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  40.7 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.24 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  37.17 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  42.22 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  41.86 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  39.53 
 
 		 99 aa  67.4  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  41.46 
 
 		 106 aa  67  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.47 
 
 		 346 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 113 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  41.89 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  35.2 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.17 
 
 		 480 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  38.33 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  39.53 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  33.05 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  40.23 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  31.97 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  36.08 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  34.44 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  39.29 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 		 469 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  30.16 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  30.71 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  38.2 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  30.71 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  37.93 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  36.78 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  37.93 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  30.89 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  33.05 
 
 		 538 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.76 
 
 		 478 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  34.52 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  35.71 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.76 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.76 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.76 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  37.76 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  30.91 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  36.9 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  34.88 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  34.71 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  37.76 
 
 		 478 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.8 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 438 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  31.97 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  32.56 
 
 		 470 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  36.9 
 
 		 480 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  33.33 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  32.69 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 415 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  37.08 
 
 		 478 aa  58.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  31.43 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  30.7 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  33.9 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  30.16 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>