More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1406 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  100 
 
 		 119 aa  246  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  70.59 
 
 		 119 aa  190  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  70.59 
 
 		 119 aa  186  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  67.8 
 
 		 119 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2877  rhodanese domain-containing protein  64.71 
 
 		 119 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00119575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2802  rhodanese domain-containing protein  64.71 
 
 		 119 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000152908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2782  rhodanese domain-containing protein  64.71 
 
 		 119 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0245575  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1575  Rhodanese domain protein  64.71 
 
 		 119 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.34236  hitchhiker  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  64.71 
 
 		 119 aa  167  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1452  rhodanese domain-containing protein  63.87 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0322334  hitchhiker  0.00868672 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1440  rhodanese domain-containing protein  63.87 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130754  hitchhiker  0.00000490376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1387  rhodanese domain-containing protein  63.87 
 
 		 119 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873164  hitchhiker  0.000000184443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  64.71 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  52.07 
 
 		 125 aa  126  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  46.72 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  45.9 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  42.15 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  41.32 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  41.59 
 
 		 123 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  39.13 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  36.61 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  36.8 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.79 
 
 		 389 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  40.37 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.61 
 
 		 393 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  38.05 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  36 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  39.53 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  40.7 
 
 		 99 aa  72  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  41.38 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  40.7 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  42.35 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  38.89 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  31.75 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  42.35 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.65 
 
 		 480 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  43.59 
 
 		 126 aa  67  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  37 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  35.58 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  32.38 
 
 		 361 aa  65.5  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.86 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  43.04 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  32.77 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  36.67 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1167  beta-lactamase domain protein  30.19 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.705193  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.14 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  35.58 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4028  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  32.35 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  30.33 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  32.35 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  33.91 
 
 		 480 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  33.88 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0222  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0155932  hitchhiker  0.00402111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  35.29 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01280  hypothetical protein  38.96 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000449614  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  37.65 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  31.36 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  36.14 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  28.12 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 438 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  35.63 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  37.21 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  40.79 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  36.47 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4138  Rhodanese domain protein  31.68 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  34.12 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2325  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0667353  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.63 
 
 		 480 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  36.17 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2720  Rhodanese domain protein  38.96 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000079592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  31.13 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  36.05 
 
 		 377 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  39.76 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4164  Rhodanese domain protein  31 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.741744  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16580  Rhodanese-related sulfurtransferase  39.51 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0172752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  39.08 
 
 		 280 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  37.35 
 
 		 471 aa  57  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1138  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000773759  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4022  rhodanese-like protein  30.69 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.203152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  31.67 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  30.69 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  34.94 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>