More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4950 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 129 aa  263  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  75 
 
 		 130 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  71.88 
 
 		 130 aa  204  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  65.89 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  63.57 
 
 		 131 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  65.04 
 
 		 126 aa  176  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  62.79 
 
 		 131 aa  174  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  60.47 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  51.61 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  44.17 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  42.74 
 
 		 128 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  47.2 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  42.15 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  42.15 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  41.32 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  42.42 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  40.8 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  39.02 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  40.16 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  38.21 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  37.9 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  40.5 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  39.37 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  36.57 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  41.05 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  37.6 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  37.82 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  38.4 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  36.21 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  34.71 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.4 
 
 		 388 aa  79  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  38.46 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0847  Rhodanese domain protein  44.8 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  32.79 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  32.17 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  34.43 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  36.22 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  35.25 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  36.59 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 389 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  44.44 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  39.56 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  41.57 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  40.37 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.29 
 
 		 480 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  37.9 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.71 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  36.94 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  32.54 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  34.55 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  36.36 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  38.61 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.45 
 
 		 361 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  36.27 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  40.7 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  35.4 
 
 		 133 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  37 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.84 
 
 		 380 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  34.65 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  33.05 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  42.2 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  31.97 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  43.53 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.8 
 
 		 393 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  39.56 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.1 
 
 		 346 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  29.6 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  30.4 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  31.09 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 		 476 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  36.07 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  35.42 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  42.25 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  38.04 
 
 		 323 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  40.22 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 		 460 aa  58.9  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  37.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  31.07 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  30.47 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  39.53 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  39.53 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  37.27 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  40.82 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  37 
 
 		 479 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  32.54 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  39.53 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  38.37 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  39.53 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  39.53 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  37.36 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>