More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1202 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  54.1 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  51.61 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  51.64 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  49.18 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  51.64 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  47.15 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  46.72 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  46.72 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  46.77 
 
 		 130 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  48.39 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  45.24 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  46.77 
 
 		 130 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  45.38 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  45.97 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  40.5 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  43.2 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  40.5 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  43.31 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  42.28 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  40.16 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  40.65 
 
 		 138 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  39.84 
 
 		 129 aa  95.9  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  39.66 
 
 		 127 aa  94.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  40.18 
 
 		 136 aa  94.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  40.48 
 
 		 141 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  39.52 
 
 		 138 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  41.13 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  41.13 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  38.98 
 
 		 130 aa  90.5  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  39.29 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  41.6 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  44.96 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  40.5 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  43.86 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  40.65 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  43.01 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  46.39 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  39.83 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.8 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  41.53 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  35.65 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  35.65 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  39.52 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  38.79 
 
 		 361 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  42.48 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  42.48 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.59 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.51 
 
 		 389 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.66 
 
 		 480 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.74 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  40.16 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  36.11 
 
 		 345 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  33.87 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  37.96 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  36.44 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.94 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  37.11 
 
 		 344 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  35 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.96 
 
 		 388 aa  64.7  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.05 
 
 		 393 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  34.91 
 
 		 346 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 		 98 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  29.51 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  35.09 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  37.19 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  40.24 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3199  hypothetical protein  39.25 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000000504945  unclonable  0.00000352479 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  34.71 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  31.15 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3448  PE-PGRS family protein  39.25 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  34.19 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  35.85 
 
 		 346 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  35.65 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0742  hypothetical protein  37.76 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0690  rhodanese-like domain-containing protein  37.76 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0702079  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.99 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.22 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  32.99 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2086  rhodanese-like protein  30.91 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.39 
 
 		 392 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.85 
 
 		 189 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  34.71 
 
 		 438 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 		 278 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  31.2 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0676  rhodanese-like domain-containing protein  39.13 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0874  rhodanese domain family protein  39.13 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000677114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>