263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2310 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  100 
 
 
127 aa  261  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  58.73 
 
 
138 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  58.87 
 
 
134 aa  155  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  59.06 
 
 
130 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  56.35 
 
 
140 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  56.69 
 
 
141 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  54.33 
 
 
141 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  54.84 
 
 
129 aa  146  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  53.23 
 
 
137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  53.08 
 
 
141 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  52.89 
 
 
137 aa  141  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  56.2 
 
 
130 aa  141  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  51.67 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  50.83 
 
 
136 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  61.22 
 
 
133 aa  127  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  45.9 
 
 
138 aa  120  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  45.08 
 
 
140 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  45.9 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  46.09 
 
 
128 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  42.61 
 
 
130 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  46.46 
 
 
131 aa  107  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  42.62 
 
 
130 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  42.37 
 
 
130 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  41.94 
 
 
131 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  39.66 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  42.37 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  40.32 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  40.32 
 
 
131 aa  93.6  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  42.02 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  39.34 
 
 
130 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  39.2 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  62.9 
 
 
71 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  42.02 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  37.17 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  37.9 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  36.89 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  32.23 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  34.26 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  32.23 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  37.04 
 
 
346 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  34.26 
 
 
346 aa  67  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  36.54 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  37.01 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  39.56 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.14 
 
 
389 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  37.7 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  37.35 
 
 
124 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  33.61 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
185 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  34.44 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.82 
 
 
361 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.75 
 
 
388 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  30.77 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  33.65 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  31.15 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.89 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  36 
 
 
323 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  26.67 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  28.95 
 
 
131 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.18 
 
 
124 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 
204 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  38.1 
 
 
123 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  28.93 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  31.68 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.03 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  29.51 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  36.19 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  25.83 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  30.93 
 
 
138 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 
153 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  33.9 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3684  putative sulfurtransferase (rhodanese)  31.93 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0311109  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  31.58 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 
459 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  38.82 
 
 
459 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  38.82 
 
 
459 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2850  Rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  38.82 
 
 
459 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  30 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  27.37 
 
 
123 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  30.58 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  38.64 
 
 
107 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.79 
 
 
393 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.81 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.36 
 
 
346 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 
459 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 
459 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>