207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4874 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 134 aa  263  8e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  66.15 
 
 		 140 aa  170  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  68.75 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  64.57 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  63.71 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  62.3 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  64.41 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  64.41 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  64.41 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  63.64 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  62.61 
 
 		 122 aa  140  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  60.16 
 
 		 131 aa  139  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  64.35 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  66.67 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  56.92 
 
 		 294 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  56.2 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  67.27 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  58.4 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  56.73 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  38.4 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  36.8 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  42.61 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.73 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.73 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.13 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  35.25 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.4 
 
 		 480 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  33.6 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  33.88 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  41.76 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  33.07 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  29.75 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  36.07 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  34.92 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  34.74 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  34.92 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  31.78 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  32.8 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.78 
 
 		 361 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  32.28 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  30.83 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  30.16 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  31.45 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.83 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  36.46 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 		 379 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.33 
 
 		 386 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  34.58 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  31.45 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  32.58 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  26.98 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  29.79 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  28.8 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  36.52 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  31.75 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  32.41 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  28.93 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  36.17 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1666  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  37.04 
 
 		 378 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.28085  normal  0.198345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  25.62 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 459 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 467 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  29.51 
 
 		 126 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  36 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 		 136 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  30.25 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  32.98 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  32 
 
 		 323 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  30.25 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  21.31 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  31.13 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  30.11 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  32 
 
 		 476 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  39.8 
 
 		 460 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  27.66 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.35 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  31.58 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.7 
 
 		 388 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  33.04 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0206  Rhodanese domain protein  40.48 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  32.65 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  26.6 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.28 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  21.31 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  32.14 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  31.52 
 
 		 479 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  36.56 
 
 		 459 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2517  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  0.344118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>