More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4591 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  73.85 
 
 		 130 aa  206  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  56.93 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  60.48 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  50.77 
 
 		 136 aa  149  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  100 
 
 		 71 aa  148  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  49.23 
 
 		 136 aa  147  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  59.5 
 
 		 129 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  55.2 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  55.28 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  57.72 
 
 		 137 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  52.85 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  55.65 
 
 		 141 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  54.55 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  52.42 
 
 		 131 aa  130  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  53.23 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  50.82 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  57.58 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  47.66 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  49.18 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  44.63 
 
 		 130 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.52 
 
 		 131 aa  106  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  43.8 
 
 		 130 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  40.8 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  43.7 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  45.38 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  43.7 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  40.77 
 
 		 130 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  37.4 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  38.98 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  38.21 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  42.11 
 
 		 344 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  39.64 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  39.64 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  35.83 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  38.02 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  38.54 
 
 		 345 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.97 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  39.83 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  36.13 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  35.51 
 
 		 346 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  37.61 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.66 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  35.25 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  32.77 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  39.34 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  37.23 
 
 		 346 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  32.2 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.15 
 
 		 354 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 323 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.36 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  39.78 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  41.3 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  33.88 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  37.38 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  35 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  35 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  33.33 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  36.8 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0691  Rhodanese domain protein  34.58 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0493491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  38.78 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  38 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  33.08 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0944  rhodanese-like protein  32.03 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000864682  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  31.19 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 476 aa  53.9  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0124  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.05 
 
 		 393 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  35.09 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  35.8 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  33.98 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  38.89 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  35.71 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  29.69 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3836  rhodanese domain-containing protein  34.91 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1862  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.364067  normal  0.0328946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1744  Rhodanese domain protein  40.45 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.664688  normal  0.136709 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 467 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1731  hypothetical protein  36.94 
 
 		 376 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  36.89 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  31.3 
 
 		 476 aa  51.6  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 		 459 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  34.74 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  25.81 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4704  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  26.61 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>