73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6069 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 204 aa  384  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  46.05 
 
 		 131 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  46.41 
 
 		 140 aa  108  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  43.79 
 
 		 163 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  60.87 
 
 		 130 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  56.73 
 
 		 134 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  58.24 
 
 		 127 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  42.59 
 
 		 141 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  39.49 
 
 		 133 aa  98.2  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  52.22 
 
 		 131 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  54.88 
 
 		 124 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  51.72 
 
 		 294 aa  88.2  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  48.91 
 
 		 124 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  48.91 
 
 		 124 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  48.91 
 
 		 124 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  47.25 
 
 		 138 aa  84.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  50.57 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 122 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  32.77 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  37.11 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  36.56 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  34.78 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  35.56 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  36.46 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  34.41 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  34.44 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  35.23 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  39.18 
 
 		 130 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  38.61 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  33.61 
 
 		 120 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  34.44 
 
 		 125 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  39.8 
 
 		 346 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  35.48 
 
 		 130 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  34.74 
 
 		 133 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  35.48 
 
 		 130 aa  52  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  32.98 
 
 		 130 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  35.79 
 
 		 128 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  34.91 
 
 		 136 aa  51.2  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  32.97 
 
 		 129 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 140 aa  51.6  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 130 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  31 
 
 		 131 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  32.99 
 
 		 141 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  41.05 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 130 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  34.09 
 
 		 129 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  35.11 
 
 		 140 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  32.29 
 
 		 126 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1979  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 134 aa  45.1  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  32.98 
 
 		 132 aa  44.3  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.58 
 
 		 389 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  24.14 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  25.89 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  29.35 
 
 		 140 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  30.68 
 
 		 130 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2326  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 		 467 aa  43.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  31.91 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2223  Rhodanese domain protein  35.09 
 
 		 108 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  33.65 
 
 		 361 aa  42.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 106 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  32.99 
 
 		 126 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3362  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 108 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352544 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  28.87 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  42  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  25.81 
 
 		 124 aa  41.6  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1239  rhodanese-like protein  34.48 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.549266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  33.62 
 
 		 108 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>