53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1109 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  100 
 
 		 71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  80.28 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  55.13 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  64.62 
 
 		 134 aa  88.2  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  50.7 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  62.9 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  56.06 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  61.54 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  60 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  60 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  50.7 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  60 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  58.46 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  60 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  58.46 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  60 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  51.52 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  50 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  45.83 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  42.65 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  46.97 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  46.97 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  42.25 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  45.45 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  42.25 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  45.45 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  45.31 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  42.25 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  48.44 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  40.62 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  40.62 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.15 
 
 		 389 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0787  Rhodanese domain protein  42.22 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403999  normal  0.138616 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  40.3 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  45.83 
 
 		 346 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  34.33 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  40.3 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  40.3 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  44.9 
 
 		 344 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  39.39 
 
 		 130 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  44.9 
 
 		 346 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  37.88 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 131 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  47.92 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  47.92 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  37.29 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  40.3 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  39.13 
 
 		 476 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2894  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127379  normal  0.672082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>