More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2917 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  100 
 
 		 137 aa  283  7e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  71.53 
 
 		 137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  70.59 
 
 		 140 aa  206  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  70.8 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  70.29 
 
 		 138 aa  204  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  72.26 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  68.99 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  60 
 
 		 134 aa  160  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  54.2 
 
 		 138 aa  145  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  51.82 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  54.26 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  52.89 
 
 		 127 aa  137  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  52.42 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  54.55 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  50.43 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  51.28 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  48.87 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  57.84 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  46.56 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  43.85 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  47.15 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  49.19 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  44.35 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  42.74 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  40.5 
 
 		 125 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  42.15 
 
 		 131 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  42.15 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  40.77 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  41.32 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  38.4 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  39.02 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  37.6 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  60 
 
 		 71 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  34.51 
 
 		 361 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  33.9 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  38.52 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  38.14 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  37.07 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  34.71 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  34.91 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  36.21 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  34.91 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.04 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  35.04 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  35.04 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  32.23 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  33.87 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  33.33 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  37.3 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  37.07 
 
 		 294 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  32.5 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  38.55 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  34.13 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  33.06 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  39.81 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.23 
 
 		 389 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  32.74 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  29.66 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.61 
 
 		 393 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5025  Rhodanese domain protein  39.81 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.569347 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  29.84 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.43 
 
 		 346 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  31.86 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.6 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.67 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5070  rhodanese domain-containing protein  35.9 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.34245  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_002936  DET1392  rhodanese-like domain-containing protein  29.82 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  29.03 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  35.96 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  32.48 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1330  rhodanese domain-containing protein  35.65 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.434015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  32.48 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5363  Rhodanese domain protein  33.04 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0678  Rhodanese domain protein  36.61 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.682716 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1257  hypothetical protein  43.84 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.265625  normal  0.967549 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  30.48 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1173  rhodanese-like domain protein  28.07 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  34.44 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  29.27 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  34.74 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  32.26 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1392  rhodanese domain-containing protein  34.26 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100688  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  31.5 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  36.73 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0241  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>