70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2034 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  84.3 
 
 
122 aa  203  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  83.19 
 
 
124 aa  196  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  83.19 
 
 
124 aa  196  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  83.19 
 
 
124 aa  196  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  77.78 
 
 
131 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  75.44 
 
 
138 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  69.23 
 
 
294 aa  154  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  68.38 
 
 
127 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  66.67 
 
 
140 aa  147  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  64.66 
 
 
163 aa  141  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  62.61 
 
 
134 aa  140  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  61.86 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  56.41 
 
 
130 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  51.69 
 
 
133 aa  114  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  51.72 
 
 
124 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  53.15 
 
 
131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  48.25 
 
 
131 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6069  Rhodanese domain protein  50.57 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 
129 aa  70.1  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  33.96 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  35.25 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  31.13 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0291  Rhodanese domain protein  36 
 
 
125 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.49635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  33.72 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  32.48 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  36.05 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  30 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  36.05 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  36.05 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  34.4 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  32.76 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  28.7 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  30.43 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  29.57 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  32.77 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  33.88 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  29.91 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  32.79 
 
 
141 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  30.58 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  30.7 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  30.43 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  29.82 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  33.33 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  30.63 
 
 
125 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  30.97 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  30.97 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5002  rhodanese domain-containing protein  34.95 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.589759  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  26.32 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  30.25 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.48 
 
 
480 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  29.46 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  30.33 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0934  Rhodanese domain protein  32.18 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.20591  normal  0.0292515 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  29.31 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4001  hypothetical protein  35.16 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 
460 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.2 
 
 
361 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  31.33 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  34.91 
 
 
459 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  33.33 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  34.15 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  28.57 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.43 
 
 
380 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.93 
 
 
388 aa  40  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>