12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4001 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4001  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  276  8e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0570  hypothetical protein  46.34 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.739902  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  32.38 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  36 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  36.96 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  38.3 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  36.56 
 
 		 131 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  38.38 
 
 		 134 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  34.09 
 
 		 294 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>