267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1792 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  66.48 
 
 		 549 aa  671    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  74 
 
 		 527 aa  794    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  100 
 
 		 527 aa  1065    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  66.48 
 
 		 549 aa  671    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  60.68 
 
 		 535 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  94.12 
 
 		 527 aa  1008    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  65.64 
 
 		 535 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  72.68 
 
 		 528 aa  772    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  67.05 
 
 		 533 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  64.2 
 
 		 532 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  66.67 
 
 		 533 aa  687    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  72.49 
 
 		 527 aa  737    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  63.53 
 
 		 541 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  63.45 
 
 		 555 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  63.26 
 
 		 541 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  59.35 
 
 		 528 aa  625  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  64.2 
 
 		 569 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  62.88 
 
 		 568 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  62.88 
 
 		 568 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  61.63 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  62.69 
 
 		 541 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  61.12 
 
 		 525 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  49.03 
 
 		 539 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  60.59 
 
 		 411 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  43.91 
 
 		 774 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  43.14 
 
 		 551 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  42.53 
 
 		 545 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  43 
 
 		 523 aa  355  8.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  40.37 
 
 		 739 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  42.53 
 
 		 548 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  41.83 
 
 		 529 aa  343  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  41.09 
 
 		 931 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  41.75 
 
 		 531 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  42.02 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  41.8 
 
 		 528 aa  333  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  40.58 
 
 		 538 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  41.02 
 
 		 530 aa  322  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  41.27 
 
 		 555 aa  319  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  38.03 
 
 		 526 aa  311  1e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  39.41 
 
 		 896 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 380 aa  250  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  40.18 
 
 		 361 aa  240  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  33.15 
 
 		 521 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  29.61 
 
 		 549 aa  160  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  32.09 
 
 		 220 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  24.85 
 
 		 617 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  24.33 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  25.84 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  27.16 
 
 		 216 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  24.22 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  23.88 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  31.63 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  31.63 
 
 		 124 aa  64.7  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  29.28 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 125 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  26.5 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  24.87 
 
 		 252 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2058  Rhodanese domain protein  27.32 
 
 		 388 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  36.36 
 
 		 119 aa  58.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.41 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  34.48 
 
 		 138 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  27.59 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0320  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 103 aa  55.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000962456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  25 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  28.81 
 
 		 123 aa  54.3  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.7 
 
 		 389 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  28.78 
 
 		 455 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  31.71 
 
 		 144 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2853  Rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 116 aa  52.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0022  Rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 122 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  24.72 
 
 		 99 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  35.79 
 
 		 361 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  36.05 
 
 		 163 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.96 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  30 
 
 		 159 aa  52  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  34.09 
 
 		 135 aa  51.6  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.52 
 
 		 380 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  30.63 
 
 		 198 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 284 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  27.84 
 
 		 272 aa  51.6  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 120 aa  51.2  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4614  Rhodanese domain protein  31.48 
 
 		 129 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0480272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1508  Rhodanese domain protein  22.73 
 
 		 352 aa  51.2  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.018848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  31.19 
 
 		 129 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0930  sulfur transferase, putative, selenocysteine-containing  25.41 
 
 		 423 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  26.45 
 
 		 393 aa  50.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  36.59 
 
 		 126 aa  50.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  27.12 
 
 		 123 aa  50.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  34.44 
 
 		 354 aa  50.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  33 
 
 		 132 aa  50.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.97 
 
 		 138 aa  50.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  36.73 
 
 		 113 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  35.11 
 
 		 140 aa  50.8  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  29.53 
 
 		 470 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.27 
 
 		 386 aa  50.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 135 aa  50.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  30.21 
 
 		 144 aa  50.4  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.97 
 
 		 393 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>