More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0680 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  32.71 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  31.62 
 
 
265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  29.78 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  29.82 
 
 
274 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  30.07 
 
 
277 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  30.07 
 
 
277 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  30.69 
 
 
277 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  29.45 
 
 
274 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  29.64 
 
 
277 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  30.07 
 
 
277 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  30.07 
 
 
277 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  30.07 
 
 
277 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  30.07 
 
 
277 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  30.11 
 
 
277 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  29.2 
 
 
279 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  30.07 
 
 
277 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.11 
 
 
276 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  25.57 
 
 
276 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  25.77 
 
 
272 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1145  Rhodanese domain protein  30.47 
 
 
262 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709325  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  26.54 
 
 
272 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  27.08 
 
 
613 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  25.74 
 
 
282 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1807  Rhodanese domain protein  29.34 
 
 
264 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  26.71 
 
 
285 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  25.74 
 
 
282 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  28.87 
 
 
271 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  30.37 
 
 
281 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2079  rhodanese domain-containing protein  26.14 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  26.47 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  26.23 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  30.42 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  28.8 
 
 
272 aa  97.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  29.89 
 
 
282 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  28 
 
 
271 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  24.63 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  26.15 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  28.4 
 
 
291 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  28.29 
 
 
321 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  28.29 
 
 
321 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  30.41 
 
 
269 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  28.44 
 
 
610 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  25.87 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.91 
 
 
286 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  27.71 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  28.69 
 
 
305 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  27.1 
 
 
308 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.02 
 
 
285 aa  93.2  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  29.7 
 
 
284 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  26.67 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.24 
 
 
280 aa  92.4  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  25 
 
 
355 aa  92.8  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  27.85 
 
 
281 aa  92.4  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  29.35 
 
 
284 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  30.41 
 
 
269 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  28.85 
 
 
291 aa  92  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  28.92 
 
 
284 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2805  rhodanese domain-containing protein  26.98 
 
 
362 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  26.55 
 
 
284 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  28.08 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  25.62 
 
 
291 aa  89.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  27.13 
 
 
282 aa  89.7  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  27.97 
 
 
335 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  25.09 
 
 
281 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  28.24 
 
 
294 aa  89  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  26.84 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  29.9 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0689  rhodanese domain-containing protein  28.08 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  26.1 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.22 
 
 
284 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  28.57 
 
 
285 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  28.08 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.91 
 
 
284 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  25.49 
 
 
297 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  28.89 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  27.86 
 
 
284 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28290  rhodanese-related sulfurtransferase  27.95 
 
 
310 aa  86.3  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2517  rhodanese-like domain/cysteine-rich domain-containing protein  28.46 
 
 
665 aa  85.5  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5151  rhodanese domain-containing protein  25.74 
 
 
321 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541862  normal  0.700824 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1095  Rhodanese domain protein  29.31 
 
 
271 aa  85.5  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  24.44 
 
 
281 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  27.46 
 
 
271 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  24.52 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  24.44 
 
 
281 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  27.98 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1989  Rhodanese domain protein  23.95 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.576744  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  25.17 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  24.35 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.23 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  25.72 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  25.54 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  23.77 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  25.2 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  29.03 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  29.5 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.78 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.46 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>