More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0510 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  100 
 
 		 271 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  81.55 
 
 		 613 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  81.18 
 
 		 610 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  80.07 
 
 		 271 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  80.44 
 
 		 271 aa  447  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  80.07 
 
 		 271 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  76.01 
 
 		 269 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  75.28 
 
 		 269 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  75.28 
 
 		 269 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  75.28 
 
 		 269 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  72.22 
 
 		 271 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  47.99 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  43.45 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  45.42 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  41.79 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  40.6 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  34.75 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  32.26 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  33.21 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  32.14 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  30.74 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  30.74 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  30.74 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  31.15 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  30.74 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  30.33 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  29.92 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  35.1 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  34.14 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  31.15 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  32.93 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  31.2 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  32.57 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  32.94 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  30.2 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  34.1 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1052  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 366 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.911033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  30.11 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  31.32 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  28.69 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  33.74 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  30.98 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  30.98 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  33.72 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  29.84 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2047  rhodanese-like protein  28.14 
 
 		 294 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000810205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  34.43 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  32.02 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  33.57 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1808  Rhodanese domain protein  31.64 
 
 		 297 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  33.57 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  30.99 
 
 		 284 aa  112  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  31.43 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  30.13 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  30.55 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  30.13 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  28.83 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1146  Rhodanese domain protein  29.66 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0368023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  30.23 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  30.13 
 
 		 289 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  29.63 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  30.23 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  30.23 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  28.87 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  28.99 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  29.76 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  30.86 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  29.75 
 
 		 477 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  28.47 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  31.23 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6245  rhodanese domain-containing protein  28.52 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293222  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  30.04 
 
 		 285 aa  108  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  31.98 
 
 		 306 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  30.33 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  30.83 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1422  rhodanese domain-containing protein  29.77 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.83 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.83 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0252  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1977  rhodanese domain-containing protein  31.05 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  32.27 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  31 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  32.13 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.89 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.46 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0587  rhodanese domain-containing protein  31.85 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.287178  normal  0.0572789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  26.97 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0965  rhodanese-like protein  28.74 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  30.77 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  29.88 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>