More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4907 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  96.28 
 
 		 269 aa  530  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  95.91 
 
 		 269 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  91.08 
 
 		 269 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  76.38 
 
 		 613 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  74.54 
 
 		 610 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  76.01 
 
 		 271 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  75.65 
 
 		 271 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  75.28 
 
 		 271 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  72.69 
 
 		 271 aa  400  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  70 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  47.01 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  43.96 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  46.89 
 
 		 276 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  41.18 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  38.2 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  32.82 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  33.96 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  32.5 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  32.49 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  29.93 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  34.02 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  34.25 
 
 		 286 aa  126  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  33.61 
 
 		 321 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  30.42 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  31.03 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  32.1 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  32.87 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  31.42 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  29.86 
 
 		 295 aa  118  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  30.39 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  32.46 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  32.93 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  32.45 
 
 		 280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  29.21 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  31.93 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  28.26 
 
 		 275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  30.45 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  31.25 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  32.34 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  32.34 
 
 		 293 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  29.96 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  30.56 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  31.34 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  34.03 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  31.34 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  31.34 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.4 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  33.6 
 
 		 305 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  29.46 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.69 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  28.69 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  31.17 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  30.53 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.29 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1161  Rhodanese domain protein  30.24 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.459743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  28.29 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  30.2 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  29.96 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1560  rhodanese domain-containing protein  27.3 
 
 		 321 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000411556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  27.89 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  31.58 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  28.29 
 
 		 277 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  30.65 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1807  Rhodanese domain protein  30.4 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  28.63 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  28.67 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  29.43 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  29.28 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  31.75 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.32 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  32.78 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.67 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  31.52 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  29.45 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1422  rhodanese domain-containing protein  29.39 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.61 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  30.61 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  29.7 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  31.05 
 
 		 335 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.61 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.61 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  31.54 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  30.61 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.61 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  30.36 
 
 		 312 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.2 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  30.61 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  27.94 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0405  rhodanese domain-containing protein  28 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>