More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0559 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  92.52 
 
 		 613 aa  1142    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 610 aa  1246    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  90.78 
 
 		 286 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  88.85 
 
 		 287 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  88.15 
 
 		 287 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  87.8 
 
 		 287 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  87.8 
 
 		 287 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  83.27 
 
 		 286 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  81.6 
 
 		 289 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  80.9 
 
 		 289 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  81.18 
 
 		 271 aa  457  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  78.23 
 
 		 271 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  77.86 
 
 		 271 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  72.24 
 
 		 286 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  76.38 
 
 		 271 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  75.65 
 
 		 269 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  75.28 
 
 		 269 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  74.54 
 
 		 269 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  74.91 
 
 		 269 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  71.48 
 
 		 271 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  59.21 
 
 		 286 aa  346  7e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  57.75 
 
 		 286 aa  327  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  56.38 
 
 		 286 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  59.15 
 
 		 280 aa  324  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  56.18 
 
 		 287 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  54.96 
 
 		 292 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  54.96 
 
 		 292 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  54.96 
 
 		 292 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  54.96 
 
 		 292 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  54.42 
 
 		 287 aa  307  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  55.71 
 
 		 316 aa  303  6.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  53.36 
 
 		 287 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  60.32 
 
 		 288 aa  302  9e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  54.68 
 
 		 288 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  53.19 
 
 		 289 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  54.42 
 
 		 286 aa  299  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  53.9 
 
 		 289 aa  299  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  51.96 
 
 		 285 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  52.84 
 
 		 292 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  52.84 
 
 		 292 aa  299  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  52.84 
 
 		 292 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  53 
 
 		 287 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  53 
 
 		 288 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  52.86 
 
 		 322 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  52.86 
 
 		 322 aa  298  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  53.52 
 
 		 293 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  52.3 
 
 		 325 aa  297  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  52.86 
 
 		 322 aa  298  3e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  52.86 
 
 		 322 aa  298  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  53.52 
 
 		 293 aa  297  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  52.86 
 
 		 322 aa  298  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  52.86 
 
 		 322 aa  298  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  52.86 
 
 		 322 aa  298  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  53.52 
 
 		 293 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  52.86 
 
 		 322 aa  298  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  52.5 
 
 		 322 aa  296  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  48.79 
 
 		 297 aa  296  7e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  53.31 
 
 		 289 aa  296  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  52.69 
 
 		 345 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  52.5 
 
 		 322 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  52.5 
 
 		 322 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  52.5 
 
 		 322 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  52.5 
 
 		 322 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  52.5 
 
 		 322 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  53.36 
 
 		 287 aa  293  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  51.6 
 
 		 285 aa  290  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  50.71 
 
 		 285 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  51.25 
 
 		 306 aa  287  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  51.59 
 
 		 286 aa  286  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  50.52 
 
 		 286 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  50.34 
 
 		 303 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  51.94 
 
 		 304 aa  281  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  50.18 
 
 		 289 aa  281  3e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  50.7 
 
 		 284 aa  280  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  51.59 
 
 		 304 aa  279  1e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  50.85 
 
 		 294 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  51.23 
 
 		 285 aa  278  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  50.18 
 
 		 299 aa  277  5e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  51.06 
 
 		 284 aa  276  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  48.77 
 
 		 294 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  48.43 
 
 		 282 aa  273  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  49.82 
 
 		 342 aa  273  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3933  phosphatidylserine decarboxylase  50.18 
 
 		 318 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  51.42 
 
 		 283 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  50 
 
 		 296 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  50 
 
 		 303 aa  268  2e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  55.35 
 
 		 273 aa  266  8.999999999999999e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  47.54 
 
 		 283 aa  263  6e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  47.37 
 
 		 289 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  50.91 
 
 		 280 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  52.57 
 
 		 293 aa  262  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  49.82 
 
 		 283 aa  262  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  46.83 
 
 		 283 aa  262  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  48.79 
 
 		 293 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  53.62 
 
 		 280 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  49.28 
 
 		 276 aa  257  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  49.08 
 
 		 284 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  49.13 
 
 		 283 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  51.84 
 
 		 293 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  48.6 
 
 		 286 aa  254  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>