More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4960 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4960  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4907  rhodanese domain protein  95.91 
 
 		 269 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4783  rhodanese domain-containing protein  94.05 
 
 		 269 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4699  rhodanese domain-containing protein  90.71 
 
 		 269 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  76.38 
 
 		 613 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  74.91 
 
 		 610 aa  417  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0510  rhodanese-like protein  75.28 
 
 		 271 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.628271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5685  thiosulfate sulfurtransferase  75.65 
 
 		 271 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65480  thiosulfate sulfurtransferase  75.65 
 
 		 271 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07450  Rhodanese  73.06 
 
 		 271 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0622  rhodanese domain-containing protein  70.74 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2528  thiosulfate sulfurtransferase  47.96 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.211267  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0191  thiosulfate sulfurtransferase  42.86 
 
 		 270 aa  225  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2678  fused rhodanese domain-containing protein/phosphatidylserine decarboxylase  46.15 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1897  thiosulfate sulfurtransferase  41.33 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.060194  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0224  rhodanese domain-containing protein  39.33 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0198439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1697  rhodanese domain-containing protein  32.82 
 
 		 258 aa  149  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.347959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0717  rhodanese domain-containing protein  30.63 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1312  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 288 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0441  rhodanese domain-containing protein  32.2 
 
 		 281 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000883325 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0920  Thiosulfate sulfurtransferase  32.62 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.189036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0312  rhodanese domain-containing protein  30.28 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.811038  normal  0.0240425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1671  Rhodanese domain protein  31.8 
 
 		 280 aa  125  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2270  Thiosulfate sulfurtransferase  32.01 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0954  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4279  Rhodanese domain protein  33.2 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0983  Rhodanese domain protein  34.55 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  33.22 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4339  Rhodanese domain protein  32.79 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0899  thiosulfate sulfurtransferase  32.1 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2206  thiosulfate sulfurtransferase  33.33 
 
 		 286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2659  Rhodanese domain protein  30.04 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119104  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5101  thiosulfate sulfurtransferase  31.44 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0501  rhodanese domain-containing protein  30.89 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3079  Rhodanese domain protein  30.71 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.946899  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0028  rhodanese domain-containing protein  32.46 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1646  thiosulfate sulfurtransferase  30.57 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0108718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  31.14 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0591  rhodanese domain-containing protein  29.51 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  33.83 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4912  thiosulfate sulfurtransferase  31.09 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4529  thiosulfate sulfurtransferase  31.09 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4616  thiosulfate sulfurtransferase  31.09 
 
 		 277 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1171  Rhodanese domain protein  31.36 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4780  rhodanese domain-containing protein  31.98 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.720691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1565  Rhodanese domain protein  30.07 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0912  Rhodanese domain protein  33.6 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0976  thiosulfate sulfurtransferase  32.71 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26242  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2352  thiosulfate sulfurtransferase  32.71 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0287651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  30.56 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.6 
 
 		 805 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  32.69 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  33.1 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  33.21 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  28.29 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.69 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  28.69 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  28.63 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  28.69 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13312  thiosulfate sulfurtransferase sseA  32.24 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  28.29 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1409  thiosulfate sulfurtransferase  31.12 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0120648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  32.58 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1291  rhodanese-like protein  31.98 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1308  rhodanese domain-containing protein  31.98 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207323  normal  0.284166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1669  rhodanese domain-containing protein  31.17 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1327  rhodanese domain-containing protein  31.98 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.905195 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  28.29 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37710  rhodanese-related sulfurtransferase  29.66 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.272937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  29.51 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4351  thiosulfate sulfurtransferase  29.82 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  0.607689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  31.43 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4986  Rhodanese domain protein  30.42 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1835  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 287 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3937  Thiosulfate sulfurtransferase  30.57 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  27.89 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  30.32 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2719  thiosulfate sulfurtransferase  29.03 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  27.89 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2652  Rhodanese domain protein  32.8 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.619492  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  28.67 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10720  rhodanese-related sulfurtransferase  31.85 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00583448  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  31.6 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4335  rhodanese domain-containing protein  27.92 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3547  Thiosulfate sulfurtransferase  29.28 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.81334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  30.51 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1488  rhodanese domain-containing protein  29.03 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.305791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  28.57 
 
 		 477 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03590  rhodanese-related sulfurtransferase  31.05 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4850  rhodanese-like protein  28.42 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.146616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7584  rhodanese domain-containing protein  31.14 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  28.37 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1807  Rhodanese domain protein  30.4 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  29.82 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.82 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>