259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21500 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  64.93 
 
 
931 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  100 
 
 
530 aa  1045    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  63.98 
 
 
551 aa  631  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  63.14 
 
 
896 aa  616  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  61.03 
 
 
529 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  61.79 
 
 
529 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  60.68 
 
 
523 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  59.01 
 
 
528 aa  557  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  58.38 
 
 
538 aa  548  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  60.54 
 
 
531 aa  542  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  53.6 
 
 
548 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  42.94 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  44.21 
 
 
525 aa  355  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  42.83 
 
 
545 aa  345  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  41.96 
 
 
549 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  41.96 
 
 
549 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  42.1 
 
 
535 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  41.63 
 
 
528 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  42 
 
 
527 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  41.02 
 
 
527 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  41.02 
 
 
527 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  40.87 
 
 
533 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  41.94 
 
 
532 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  42.11 
 
 
527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  40.42 
 
 
774 aa  313  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  42.13 
 
 
539 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  40.15 
 
 
535 aa  310  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
541 aa  309  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  41.86 
 
 
555 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  39.92 
 
 
533 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  42.08 
 
 
739 aa  301  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  43.7 
 
 
569 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  42.41 
 
 
541 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  42.01 
 
 
568 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  42.01 
 
 
568 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  40.62 
 
 
541 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  40.83 
 
 
555 aa  294  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  41.68 
 
 
569 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
528 aa  288  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2691  rhodanese domain-containing protein  44.51 
 
 
411 aa  273  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.608697  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2551  rhodanese domain-containing protein  39.43 
 
 
380 aa  229  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378324  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1373  Rhodanese domain protein  34.64 
 
 
521 aa  211  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2586  putative thiosulfate sulfurtransferase  36.58 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721613  normal  0.12101 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4338  Rhodanese-like protein sulfurtransferase  30.68 
 
 
549 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2892  rhodanese-like protein  25.81 
 
 
377 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.351885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0679  rhodanese-like protein  23.51 
 
 
363 aa  63.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  30.87 
 
 
220 aa  63.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.17 
 
 
129 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  31.34 
 
 
457 aa  61.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  30.43 
 
 
129 aa  61.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7246  rhodanese-related sulfurtransferase  30.69 
 
 
279 aa  60.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0149117  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0680  rhodanese domain-containing protein  26.42 
 
 
265 aa  60.1  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  23.41 
 
 
247 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2335  Rhodanese domain protein  25.53 
 
 
432 aa  57.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.120281  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  38.2 
 
 
346 aa  57.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  29.39 
 
 
480 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  29.91 
 
 
216 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1861  Rhodanese domain protein  26.79 
 
 
454 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  39.68 
 
 
312 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  30.54 
 
 
282 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  28.89 
 
 
99 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  38.98 
 
 
627 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2272  Rhodanese domain protein  24.36 
 
 
406 aa  55.1  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3773  beta-lactamase-like protein  32.73 
 
 
354 aa  53.9  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.957871  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2538  rhodanese domain-containing protein  22.61 
 
 
252 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0413586  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  28.89 
 
 
99 aa  53.9  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  30.69 
 
 
123 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10329  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
226 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  30.21 
 
 
124 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
151 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  32.11 
 
 
125 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2357  Rhodanese domain protein  24.52 
 
 
230 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0207947  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  32.63 
 
 
123 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  32.17 
 
 
301 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
113 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  32.73 
 
 
153 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  31.4 
 
 
288 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  29.17 
 
 
124 aa  51.6  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1705  Rhodanese domain protein  28.18 
 
 
185 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000174118 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  30.69 
 
 
123 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.63 
 
 
116 aa  51.6  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  36.67 
 
 
140 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  34.75 
 
 
278 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1564  rhodanese domain-containing protein  26.34 
 
 
296 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  34.12 
 
 
323 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  34.65 
 
 
113 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.28 
 
 
817 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 
390 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 
361 aa  49.7  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  30 
 
 
291 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  34.62 
 
 
114 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
392 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  32.26 
 
 
137 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0319  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 
143 aa  49.3  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.104155  normal  0.0108474 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0032  rhodanese-like protein  35.58 
 
 
157 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000171668  normal  0.0651616 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1287  rhodanese-like protein  27.97 
 
 
159 aa  48.9  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  32.41 
 
 
280 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1969  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
587 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.602757  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  27.08 
 
 
480 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  29.52 
 
 
292 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>