More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2632 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 931 aa  1881    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  62.15 
 
 		 896 aa  1118    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21500  Rhodanese-like protein  64.93 
 
 		 530 aa  683    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2041  rhodanese-like protein  61.13 
 
 		 551 aa  631  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0229793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1128  Rhodanese domain protein  60.11 
 
 		 529 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1219  Rhodanese domain protein  59.81 
 
 		 529 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.773409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0276  rhodanese domain-containing protein  59.62 
 
 		 523 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  73.11 
 
 		 388 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4136  rhodanese domain-containing protein  58.06 
 
 		 528 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3974  Rhodanese domain protein  59.5 
 
 		 531 aa  560  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.650632  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2405  rhodanese-like domain-containing protein  55.6 
 
 		 538 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1130  putative rhodanese-like sulfur transferase  51.33 
 
 		 548 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  57.14 
 
 		 405 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  56.89 
 
 		 412 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  55.9 
 
 		 388 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  56.51 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  56.15 
 
 		 388 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  57.03 
 
 		 400 aa  439  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3935  rhodanese domain-containing protein  41.52 
 
 		 526 aa  399  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30960  Rhodanese-like protein  41.75 
 
 		 527 aa  359  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.621734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2665  rhodanese domain-containing protein  42.33 
 
 		 525 aa  356  8.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00593541  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3602  rhodanese-like protein  41.15 
 
 		 527 aa  352  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717675  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2930  thiosulfate sulfurtransferase  42.64 
 
 		 533 aa  349  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1792  rhodanese-like domain protein  41.09 
 
 		 527 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3483  rhodanese domain-containing protein  40.87 
 
 		 545 aa  347  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.38512  normal  0.395437 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1549  Rhodanese domain protein  41.57 
 
 		 533 aa  345  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.996787 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1581  cystathionine beta-lyase  43.72 
 
 		 387 aa  343  1e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.975747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0279  cystathionase beta-lyase  43.95 
 
 		 389 aa  342  2e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0259  cystathionine beta-lyase  43.49 
 
 		 387 aa  341  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2512  rhodanese domain-containing protein  41.55 
 
 		 528 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756013  normal  0.563035 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1392  cystathionine beta-lyase  43.23 
 
 		 387 aa  341  4e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000072786  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4598  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 		 549 aa  340  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.664806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4464  Rhodanese domain protein  40.23 
 
 		 549 aa  340  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5044  rhodanese-like protein  40.35 
 
 		 535 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5232  rhodanese domain-containing protein  40.5 
 
 		 535 aa  336  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  49.48 
 
 		 407 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5775  rhodanese domain-containing protein  39.46 
 
 		 774 aa  334  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 		 401 aa  334  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  49.49 
 
 		 396 aa  332  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2215  rhodanese-like protein  41.44 
 
 		 532 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0664029  normal  0.444844 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  48.31 
 
 		 393 aa  329  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1206  cystathionine beta-lyase (CBL) (Beta-cystathionase)(cysteine lyase)  42.89 
 
 		 387 aa  325  2e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.37868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30430  thiosulfate sulfurtransferase  41.97 
 
 		 527 aa  325  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3876  Rhodanese domain protein  40.46 
 
 		 541 aa  323  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3257  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 		 541 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4330  rhodanese domain-containing protein  43.39 
 
 		 569 aa  318  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433624  normal  0.0780843 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  46.05 
 
 		 418 aa  317  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  46.15 
 
 		 385 aa  317  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1882  Rhodanese domain protein  38.5 
 
 		 739 aa  316  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4106  rhodanese-like protein  41.57 
 
 		 568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4260  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 		 568 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0054703  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4157  rhodanese domain-containing protein  40.85 
 
 		 541 aa  313  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.759508 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3684  rhodanese domain-containing protein  40.85 
 
 		 555 aa  313  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2158  putative thiosulfate sulfurtransferase  40.38 
 
 		 539 aa  311  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1751  rhodanese-like protein  40.98 
 
 		 569 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14689  normal  0.128287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  41.36 
 
 		 393 aa  308  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 453 aa  306  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1350  rhodanese domain-containing protein  37.6 
 
 		 528 aa  306  1.0000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.803854  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 389 aa  305  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  43.67 
 
 		 469 aa  303  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  42.15 
 
 		 391 aa  300  6e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 389 aa  300  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  42.75 
 
 		 395 aa  299  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  43.48 
 
 		 396 aa  299  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  47.69 
 
 		 398 aa  299  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  40.1 
 
 		 396 aa  298  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  41.81 
 
 		 396 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  45.75 
 
 		 388 aa  295  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 402 aa  293  7e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  39.48 
 
 		 401 aa  293  8e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2410  rhodanese-like domain-containing protein  39.33 
 
 		 555 aa  293  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 406 aa  293  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  41.34 
 
 		 389 aa  293  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 		 411 aa  293  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 407 aa  292  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  41.69 
 
 		 401 aa  292  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  41.67 
 
 		 399 aa  290  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  41.31 
 
 		 396 aa  290  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 		 399 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  41.15 
 
 		 399 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  42.31 
 
 		 388 aa  288  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  40.84 
 
 		 395 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  40.4 
 
 		 399 aa  286  9e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  40.89 
 
 		 399 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 399 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 399 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  40.27 
 
 		 396 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  39.38 
 
 		 396 aa  284  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  42.53 
 
 		 400 aa  284  7.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 399 aa  283  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  42.64 
 
 		 398 aa  282  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  40.1 
 
 		 440 aa  282  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  40.93 
 
 		 399 aa  282  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  43.19 
 
 		 388 aa  280  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 416 aa  278  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 		 388 aa  278  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 395 aa  276  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  43.97 
 
 		 418 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  39.27 
 
 		 415 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  39.75 
 
 		 395 aa  275  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>