More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2549 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 396 aa  814    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  73.48 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  71.72 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  70.48 
 
 		 469 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  66.84 
 
 		 389 aa  550  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  66.33 
 
 		 389 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  67.72 
 
 		 453 aa  542  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  64.75 
 
 		 388 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  54.07 
 
 		 395 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  52.54 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  53.52 
 
 		 397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  53.17 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  52.85 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  50.51 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  52.59 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  53.83 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  51.64 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  51.55 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  52.62 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  49.62 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  52.65 
 
 		 385 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  51.81 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  52.2 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  51.58 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  52.09 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  47.66 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  48.21 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  50 
 
 		 418 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  48.21 
 
 		 401 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  49.47 
 
 		 395 aa  363  4e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  46.33 
 
 		 393 aa  363  4e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  50.53 
 
 		 400 aa  363  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  46.33 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  47 
 
 		 407 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  46.33 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  47.23 
 
 		 388 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  48.19 
 
 		 389 aa  360  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  47.79 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  46.29 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  46.61 
 
 		 391 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  49.74 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  47.88 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  45.43 
 
 		 406 aa  352  8e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  47 
 
 		 411 aa  352  8e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  48.44 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  46.09 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  47.37 
 
 		 393 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  46.48 
 
 		 399 aa  348  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  48.18 
 
 		 399 aa  346  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  47.07 
 
 		 395 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  46.48 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  46.48 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  46.48 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  46.28 
 
 		 397 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  46.48 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  46.21 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  46.48 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  48.3 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  47.21 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  46.49 
 
 		 396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  46.12 
 
 		 401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  45.95 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  48.87 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  46.25 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  45.5 
 
 		 388 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  46.51 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  47.41 
 
 		 418 aa  330  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  45.5 
 
 		 388 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  44.78 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  49.61 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  47.67 
 
 		 398 aa  322  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  45.85 
 
 		 412 aa  322  6e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  45.69 
 
 		 415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  43.67 
 
 		 388 aa  315  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  43.23 
 
 		 896 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  45.14 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  42.43 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 395 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 440 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  45.68 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  42.18 
 
 		 395 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  45.9 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  45.39 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 		 407 aa  308  9e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  46.83 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  46.05 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 396 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  42.89 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>