More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0701 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 388 aa  801    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  90.18 
 
 		 388 aa  741    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  58.07 
 
 		 388 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  55.9 
 
 		 931 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  56.14 
 
 		 405 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  55.36 
 
 		 400 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  55.84 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  53.67 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  56.15 
 
 		 896 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  43.41 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  45.5 
 
 		 396 aa  333  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  45.6 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  45.03 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  46.63 
 
 		 407 aa  328  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  44.47 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  40.52 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  43.49 
 
 		 385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  41.37 
 
 		 407 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  46.21 
 
 		 398 aa  325  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  41.34 
 
 		 406 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  42.15 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  41.34 
 
 		 411 aa  322  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  41.88 
 
 		 399 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  41.88 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 		 395 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  43.4 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  42.56 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  41.24 
 
 		 401 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  41.41 
 
 		 399 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  43.94 
 
 		 396 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  42.38 
 
 		 399 aa  316  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  45.45 
 
 		 393 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 		 389 aa  315  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  43.43 
 
 		 400 aa  315  8e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  41.96 
 
 		 453 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  41.69 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 		 399 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 393 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  43.67 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0279  cystathionase beta-lyase  42.15 
 
 		 389 aa  311  1e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 		 401 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  40.84 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 402 aa  309  5e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  42.53 
 
 		 398 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1392  cystathionine beta-lyase  41.67 
 
 		 387 aa  309  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000072786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0259  cystathionine beta-lyase  40.94 
 
 		 387 aa  308  8e-83  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 388 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1581  cystathionine beta-lyase  41.15 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.975747  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  44.07 
 
 		 388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  41.94 
 
 		 397 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  40.16 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  40.72 
 
 		 397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  41.82 
 
 		 418 aa  300  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  40.87 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  40.42 
 
 		 388 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  41.19 
 
 		 399 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  43.75 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  39.44 
 
 		 415 aa  296  6e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1206  cystathionine beta-lyase (CBL) (Beta-cystathionase)(cysteine lyase)  40.48 
 
 		 387 aa  295  9e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.37868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  40.38 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  40.7 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  41.24 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 		 397 aa  290  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3599  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  38.14 
 
 		 396 aa  288  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  41.13 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  41.22 
 
 		 416 aa  285  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  37.89 
 
 		 396 aa  285  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  38.29 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  38.42 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  38.42 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  38.46 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  38.46 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  38.46 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  44.15 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  38.42 
 
 		 395 aa  282  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  39.07 
 
 		 395 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  38.86 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  38.42 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  38.42 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  38.42 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>