More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1884 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 401 aa  793    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  80.05 
 
 		 407 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  64.66 
 
 		 396 aa  471  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  57.51 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  53.65 
 
 		 405 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  51.3 
 
 		 400 aa  355  5.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  51.04 
 
 		 388 aa  355  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  49.48 
 
 		 412 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  50.77 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  51.42 
 
 		 896 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  50.52 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  49.09 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  48.83 
 
 		 395 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  49.74 
 
 		 398 aa  338  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 931 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1392  cystathionine beta-lyase  43.73 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000072786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  46.24 
 
 		 388 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  46.39 
 
 		 388 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  44.96 
 
 		 388 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1581  cystathionine beta-lyase  43.99 
 
 		 387 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.975747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0279  cystathionase beta-lyase  43.67 
 
 		 389 aa  332  5e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  46.65 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0259  cystathionine beta-lyase  43.48 
 
 		 387 aa  329  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  45.64 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  46.48 
 
 		 418 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  47.42 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  46.31 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  48.38 
 
 		 397 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  49.09 
 
 		 388 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  46.91 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  47.45 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  45.5 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  44.99 
 
 		 389 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  43.99 
 
 		 389 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  43.73 
 
 		 453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  48.61 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  45.27 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  46.06 
 
 		 400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  41.45 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  45.52 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1206  cystathionine beta-lyase (CBL) (Beta-cystathionase)(cysteine lyase)  41.62 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.37868  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  44.39 
 
 		 392 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  43.99 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  45.76 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  42.01 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  44.73 
 
 		 469 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  44.24 
 
 		 392 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 391 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  41.45 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  42.09 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  41.24 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  42.4 
 
 		 407 aa  293  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  42.42 
 
 		 401 aa  292  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  43.85 
 
 		 397 aa  292  7e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  40.83 
 
 		 393 aa  292  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  44.1 
 
 		 396 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  43.96 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  42.71 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  43.21 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  42.45 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  42.45 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 		 399 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 		 399 aa  288  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  43.96 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  42.45 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  42.24 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  44.79 
 
 		 388 aa  288  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  46.63 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  41.97 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  43.21 
 
 		 399 aa  286  4e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3936  cystathionine beta-lyase  39.95 
 
 		 388 aa  285  8e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  44.71 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  42.13 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  41.65 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 395 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  43.08 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 		 395 aa  282  7.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1495  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 		 385 aa  282  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.627679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 395 aa  282  9e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 395 aa  282  9e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 395 aa  282  9e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  41.39 
 
 		 395 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 		 395 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  40.92 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  42.09 
 
 		 395 aa  279  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  45.65 
 
 		 417 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  41.84 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  42.64 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  39.74 
 
 		 396 aa  278  2e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  40.48 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  40.48 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  40.48 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  41.58 
 
 		 395 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>