More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3936 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3936  cystathionine beta-lyase  100 
 
 
388 aa  809    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  43.56 
 
 
401 aa  323  4e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1392  cystathionine beta-lyase  44.1 
 
 
387 aa  323  4e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000072786  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0259  cystathionine beta-lyase  44.1 
 
 
387 aa  322  7e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1581  cystathionine beta-lyase  43.85 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.975747  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  43.3 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  43.38 
 
 
396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0279  cystathionase beta-lyase  42.78 
 
 
389 aa  317  2e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  42.27 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  43.6 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1206  cystathionine beta-lyase (CBL) (Beta-cystathionase)(cysteine lyase)  42.42 
 
 
387 aa  307  3e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.37868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  41.73 
 
 
400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  39.64 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  41.73 
 
 
405 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  41.82 
 
 
411 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  41.03 
 
 
407 aa  300  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 
412 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  40.53 
 
 
388 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  39.53 
 
 
406 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  40.21 
 
 
396 aa  295  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  41.45 
 
 
391 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  41.73 
 
 
401 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  40.84 
 
 
398 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  40.72 
 
 
398 aa  292  6e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  39.84 
 
 
401 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  41.53 
 
 
385 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  38.54 
 
 
407 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  39.07 
 
 
399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  40.68 
 
 
896 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  40.2 
 
 
397 aa  288  8e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  38.11 
 
 
389 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3599  cystathionine beta-lyase  41.46 
 
 
397 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  40.41 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  40.1 
 
 
399 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  40.87 
 
 
399 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  40.66 
 
 
395 aa  285  8e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  40.66 
 
 
395 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  40.66 
 
 
395 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  40.66 
 
 
395 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  36.69 
 
 
388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  40.05 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  39.34 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  40.87 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  40.62 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  40.62 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  39.43 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  40.15 
 
 
440 aa  282  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  40.87 
 
 
399 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  40.87 
 
 
399 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  40.15 
 
 
395 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  39.12 
 
 
398 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  40.15 
 
 
395 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  36.43 
 
 
388 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  40.15 
 
 
395 aa  282  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  38.7 
 
 
393 aa  281  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  39.43 
 
 
396 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  38.93 
 
 
398 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  40 
 
 
395 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  39.89 
 
 
396 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  39.53 
 
 
395 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  40.62 
 
 
399 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  38.62 
 
 
393 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  42.03 
 
 
396 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  38.34 
 
 
403 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  38.34 
 
 
403 aa  279  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  38.34 
 
 
403 aa  279  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  40.1 
 
 
399 aa  278  8e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  39.12 
 
 
397 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  38.24 
 
 
398 aa  277  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  37.76 
 
 
395 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  39.27 
 
 
395 aa  275  9e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  39.24 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  38.48 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  37.99 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  39.22 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  39.47 
 
 
395 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  37.34 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  38.02 
 
 
469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  39.21 
 
 
395 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  38.32 
 
 
396 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  38.95 
 
 
395 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  36.22 
 
 
388 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  38.4 
 
 
395 aa  269  5.9999999999999995e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  37.76 
 
 
396 aa  269  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  39.02 
 
 
398 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  38.24 
 
 
388 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  36.15 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  36.86 
 
 
389 aa  266  4e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  37.5 
 
 
396 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  37.66 
 
 
392 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  36.59 
 
 
453 aa  266  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  37.2 
 
 
415 aa  266  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  37.76 
 
 
395 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 
389 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  39.2 
 
 
418 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  36.36 
 
 
931 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>