More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4252 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  80.31 
 
 		 396 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 395 aa  798    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  96.46 
 
 		 395 aa  773    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  99.75 
 
 		 395 aa  797    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  74.94 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  73.67 
 
 		 395 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  69.9 
 
 		 395 aa  548  1e-155  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  64.89 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  57.47 
 
 		 393 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  57.47 
 
 		 393 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  57.47 
 
 		 393 aa  482  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  59.84 
 
 		 397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  59.69 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  58.53 
 
 		 398 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  57.11 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  58.73 
 
 		 398 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  58.44 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  57.71 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  59.16 
 
 		 398 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  57.29 
 
 		 385 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  54.5 
 
 		 469 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  51.69 
 
 		 388 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  54.24 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  54.24 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  52.58 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  52.59 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  53.66 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  54.26 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  52.88 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  51.18 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  50.66 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  50 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  52.7 
 
 		 400 aa  378  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  48.28 
 
 		 389 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  48.66 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  47.85 
 
 		 397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  45.85 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  44.91 
 
 		 407 aa  359  6e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  44.76 
 
 		 391 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  45.19 
 
 		 399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  45.71 
 
 		 401 aa  355  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  43.9 
 
 		 411 aa  352  8e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  45.13 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  44.36 
 
 		 402 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  47.26 
 
 		 389 aa  348  7e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  44.42 
 
 		 399 aa  348  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  44.42 
 
 		 399 aa  348  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  44.16 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  43.59 
 
 		 401 aa  347  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  49.22 
 
 		 415 aa  346  4e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  44.84 
 
 		 395 aa  345  7e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  43.9 
 
 		 399 aa  345  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  43.64 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  43.64 
 
 		 399 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  43.64 
 
 		 399 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  47.64 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 399 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  48.45 
 
 		 388 aa  326  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  47.78 
 
 		 418 aa  325  6e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  42.6 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  44.3 
 
 		 407 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  41.78 
 
 		 396 aa  319  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  44.19 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  42.67 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 		 403 aa  311  2e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 		 395 aa  308  8e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  41.75 
 
 		 395 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1495  cystathionine beta-lyase  46.05 
 
 		 385 aa  308  9e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.627679 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  42.53 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  45.36 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  46.29 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  42.53 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  42.53 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  42.53 
 
 		 395 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  41.75 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  41.49 
 
 		 395 aa  305  6e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3599  cystathionine beta-lyase  44.44 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  44.17 
 
 		 403 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  44.17 
 
 		 403 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  44.54 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  42.67 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  42.14 
 
 		 400 aa  298  8e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  43.64 
 
 		 405 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0540  cystathionine beta-lyase  39.79 
 
 		 396 aa  293  4e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.144132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  46.39 
 
 		 404 aa  292  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  40.99 
 
 		 394 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>