More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1852 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  95.42 
 
 		 394 aa  778    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  84.99 
 
 		 394 aa  703    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 394 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  77.18 
 
 		 469 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  77.18 
 
 		 394 aa  627  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  77.18 
 
 		 394 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  77.18 
 
 		 394 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  77.24 
 
 		 394 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  77.18 
 
 		 394 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  77.18 
 
 		 394 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  77.18 
 
 		 394 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  76.41 
 
 		 393 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  76.41 
 
 		 393 aa  618  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  76.41 
 
 		 393 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  76.15 
 
 		 394 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  75.64 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  76.67 
 
 		 393 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  76.92 
 
 		 393 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  63.24 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  62.53 
 
 		 400 aa  508  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  63.8 
 
 		 403 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  63.8 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  63.8 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  55.79 
 
 		 397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  52.63 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  50.38 
 
 		 402 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  49.27 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  50.5 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  50.12 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  48.47 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  45.88 
 
 		 407 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.26 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 399 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  48.86 
 
 		 413 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  47.14 
 
 		 398 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  44.91 
 
 		 399 aa  328  8e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  45.33 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  43.48 
 
 		 401 aa  319  5e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  44.84 
 
 		 402 aa  318  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  49.18 
 
 		 398 aa  315  8e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 469 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  43.17 
 
 		 407 aa  312  6.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  43.29 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  43.99 
 
 		 397 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  43.96 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  40.87 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  43.41 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  44.96 
 
 		 396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  43.55 
 
 		 396 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  43.32 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  43.72 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  42.01 
 
 		 398 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  44.69 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  42.9 
 
 		 406 aa  301  2e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  42.38 
 
 		 431 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  41.18 
 
 		 391 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  44.91 
 
 		 388 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  42.08 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  42.71 
 
 		 399 aa  299  7e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  44.24 
 
 		 398 aa  298  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  40.61 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  43.17 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  42.9 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  42.9 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  43.87 
 
 		 388 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  41.71 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  42.62 
 
 		 401 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  42.62 
 
 		 399 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  42.62 
 
 		 399 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  43.84 
 
 		 396 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  42.3 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  43.15 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  42.12 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  44.11 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  44.27 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  40.1 
 
 		 395 aa  292  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  42.62 
 
 		 415 aa  292  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  42.08 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  39.56 
 
 		 393 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  40.99 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  39.56 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  40.99 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  41.8 
 
 		 399 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  39.56 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  43.25 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  42.08 
 
 		 399 aa  289  7e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 418 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  41.26 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  40.54 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  41.71 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  40.73 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  39.53 
 
 		 396 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  46.32 
 
 		 410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  41.8 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  41.45 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  44.13 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  39.23 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  42.58 
 
 		 395 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>