More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1885 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 397 aa  812    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  85.53 
 
 		 396 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  65.43 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  62.84 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  62.84 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  61.43 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  61.52 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  58.23 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  57.69 
 
 		 426 aa  463  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  63.36 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  57.25 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  51.84 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  52.63 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  50.79 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  50.39 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  49.49 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  48.35 
 
 		 403 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  49.87 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  48.1 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  48.33 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  48.07 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  48.33 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  48.33 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  48.07 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  47.91 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  48.84 
 
 		 393 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  46.86 
 
 		 400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  49.37 
 
 		 404 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  39.44 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  43.65 
 
 		 398 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  42.28 
 
 		 388 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  43.91 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  42.63 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  40.41 
 
 		 431 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  40.75 
 
 		 469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 400 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  41.41 
 
 		 405 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2139  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  41.9 
 
 		 396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  40.27 
 
 		 398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  41.67 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  40.25 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  38.85 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  38.54 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  39.6 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 388 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  39.42 
 
 		 397 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  39.47 
 
 		 399 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  39.03 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  39.59 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  39.89 
 
 		 385 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  40.38 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  38.89 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  38.62 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  38.11 
 
 		 398 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  39.1 
 
 		 396 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  40.11 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  38.07 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  39.57 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  37.34 
 
 		 395 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  44.27 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  38.73 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  40.92 
 
 		 388 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 388 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  39.27 
 
 		 398 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  38.62 
 
 		 418 aa  253  3e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  35.28 
 
 		 395 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  39.33 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  38.13 
 
 		 389 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  39.05 
 
 		 398 aa  253  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  37.97 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  37.07 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  37.19 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  35.28 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0426  cystathionine beta-lyase  41.67 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  35.28 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  35.53 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  35.1 
 
 		 440 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  35.28 
 
 		 395 aa  249  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  41.05 
 
 		 410 aa  248  9e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  37.33 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  37.33 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  40.49 
 
 		 896 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  37.33 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>