More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1779 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  93.38 
 
 		 394 aa  764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  90.84 
 
 		 393 aa  729    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  84.99 
 
 		 394 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  84.73 
 
 		 469 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  96.44 
 
 		 393 aa  769    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  84.99 
 
 		 394 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  84.99 
 
 		 394 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  84.73 
 
 		 394 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  84.99 
 
 		 394 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  84.99 
 
 		 394 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  99.75 
 
 		 393 aa  802    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 393 aa  805    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  84.99 
 
 		 394 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  94.66 
 
 		 394 aa  773    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 393 aa  805    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  76.53 
 
 		 394 aa  624  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  76.41 
 
 		 394 aa  617  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  75.7 
 
 		 394 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  62.66 
 
 		 400 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  62.22 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  60.82 
 
 		 403 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  60.41 
 
 		 403 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  61.86 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  52.82 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  50.5 
 
 		 402 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  49.39 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  48.33 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  51.36 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  47.4 
 
 		 407 aa  362  8e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  48.15 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  48.23 
 
 		 413 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  48.15 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  47.68 
 
 		 396 aa  359  5e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  47.17 
 
 		 422 aa  355  7.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.93 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  44.27 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  45.65 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  41.37 
 
 		 469 aa  299  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  43.73 
 
 		 396 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  46.13 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  42.67 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  42.02 
 
 		 431 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  43.12 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  42.09 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  45.08 
 
 		 388 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  43.37 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2139  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  42.32 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  41.64 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  41.37 
 
 		 397 aa  282  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 388 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  43.96 
 
 		 400 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  42.58 
 
 		 407 aa  281  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  42.31 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  42.75 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  42.75 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  43.32 
 
 		 395 aa  278  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  42.98 
 
 		 389 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  43.32 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  43.41 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  43.53 
 
 		 395 aa  277  3e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 398 aa  276  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  41.19 
 
 		 398 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  44.36 
 
 		 388 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  43.18 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  43.06 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  43.18 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  42.21 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  42.58 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  43.05 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  42.31 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  42.31 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  42.23 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  39.64 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  39.03 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  44.86 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  41.27 
 
 		 415 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 		 411 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  40.16 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  39.39 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  41.97 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  42.62 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  41.45 
 
 		 399 aa  269  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  40.49 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  42.03 
 
 		 399 aa  269  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 		 418 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  42.9 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  40.93 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  39.84 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  41.71 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  42.22 
 
 		 395 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  40.16 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  40.68 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  41.15 
 
 		 395 aa  266  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  41.76 
 
 		 397 aa  266  7e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  42.12 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  40.62 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  41.27 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>