More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3409 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  100 
 
 		 426 aa  865    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  74.88 
 
 		 413 aa  608  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  72.58 
 
 		 415 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  72.21 
 
 		 415 aa  597  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  70.39 
 
 		 402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  71.12 
 
 		 422 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  65.61 
 
 		 397 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  65.86 
 
 		 399 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  57.69 
 
 		 397 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  57.55 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  58.05 
 
 		 399 aa  445  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  49.63 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  49.27 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  49.39 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  49.39 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  48.77 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  49.39 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  48.91 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  48.91 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  48.91 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  48.91 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  48.91 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  50.36 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  48.54 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  48.91 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  49.02 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  48.91 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  48.91 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  48.77 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  47.51 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  47.49 
 
 		 400 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  45.06 
 
 		 403 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  45.37 
 
 		 403 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  45.85 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  38.97 
 
 		 407 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  39.16 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  40.25 
 
 		 398 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2139  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  38.44 
 
 		 396 aa  255  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  38.01 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  39.26 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  38.86 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  36.83 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  37.47 
 
 		 393 aa  242  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  36.89 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  38.18 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  37.59 
 
 		 396 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  35.63 
 
 		 388 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  37.53 
 
 		 393 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  37.11 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  37.2 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  35.73 
 
 		 453 aa  236  7e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  40.81 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  38.35 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  38.9 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  35.73 
 
 		 389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  35.34 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  36.84 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  34.4 
 
 		 393 aa  233  4.0000000000000004e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  38.89 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  36.51 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  35.46 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  35.85 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  36.14 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  37.66 
 
 		 395 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  38.65 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  33.41 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  33.92 
 
 		 401 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  33.17 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  36.98 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  33.57 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  33.57 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  33.17 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  33.57 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  35.76 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  39.85 
 
 		 400 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  32.93 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  32.93 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  32.93 
 
 		 395 aa  226  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  36.9 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  32.93 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  32.69 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  38.65 
 
 		 896 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  36.17 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  36.75 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  32.69 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  32.69 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  36.04 
 
 		 398 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  32.69 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  32.22 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  35.71 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  32.22 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  33.01 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  32.22 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  34.87 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  33.25 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  36.21 
 
 		 392 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  38.5 
 
 		 393 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  35.28 
 
 		 398 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>