More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2381 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  100 
 
 		 393 aa  804    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  53.51 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  52.47 
 
 		 388 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  49.08 
 
 		 398 aa  342  8e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  43.95 
 
 		 415 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  45.11 
 
 		 417 aa  289  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  43.52 
 
 		 403 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  43.31 
 
 		 394 aa  285  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  43.01 
 
 		 403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  42.49 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  42.48 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  42.48 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  42.48 
 
 		 469 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  42.48 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  42.48 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  41.84 
 
 		 394 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  42.48 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  39.84 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  42.22 
 
 		 394 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  40.57 
 
 		 407 aa  275  8e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  42.06 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  41.97 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  41.82 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  41.51 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  43.72 
 
 		 404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  41.27 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  41.15 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  41.27 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  41.27 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  40.7 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  39.59 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 398 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  41.64 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  40.7 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  40.7 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  41.38 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  41.38 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  39.07 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  40.64 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  39.18 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  42.27 
 
 		 396 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  38.46 
 
 		 413 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  38.66 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.95 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  42.62 
 
 		 400 aa  249  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  39.18 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  40.9 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  39.57 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  39.42 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.28 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  38.87 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  41.6 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  42.47 
 
 		 401 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  40.36 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  38.69 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 418 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  39.62 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  38.81 
 
 		 406 aa  246  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  38.32 
 
 		 397 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  39.52 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  37.73 
 
 		 402 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  39.52 
 
 		 399 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  38.42 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  39.52 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  39.07 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 398 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  40.33 
 
 		 896 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  38.68 
 
 		 389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0426  cystathionine beta-lyase  41.81 
 
 		 356 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  37.53 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  36.73 
 
 		 389 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5109  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  38.98 
 
 		 385 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  37.47 
 
 		 426 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1884  cystathionine beta-lyase  40.73 
 
 		 401 aa  242  9e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  41.1 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  38.99 
 
 		 399 aa  242  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  40.76 
 
 		 412 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  40.43 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  38.73 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  39.19 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  38.36 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  38.36 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  38.07 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  37.72 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.72 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  37.1 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  40.22 
 
 		 407 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  38.07 
 
 		 399 aa  239  8e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  38.86 
 
 		 399 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  37.63 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  38.54 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  40.11 
 
 		 931 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  39.89 
 
 		 385 aa  237  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  37.67 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  37.43 
 
 		 402 aa  236  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  38.56 
 
 		 395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>