More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5109 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5109  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 385 aa  786    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  45.19 
 
 		 393 aa  298  8e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  44.62 
 
 		 401 aa  298  8e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  43.09 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  45.45 
 
 		 398 aa  295  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  43.32 
 
 		 393 aa  295  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  43.75 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  44.84 
 
 		 396 aa  292  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  45.15 
 
 		 395 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  44.14 
 
 		 398 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  44.32 
 
 		 397 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  43.32 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  42.55 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  42.19 
 
 		 407 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  43.01 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  43.48 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  43.78 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  41.01 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 395 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  43.51 
 
 		 395 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  43.01 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  43.01 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  42.47 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 415 aa  278  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  42.7 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  42.51 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  42.7 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  41.46 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  42.47 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  42.47 
 
 		 399 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  42.47 
 
 		 399 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  42.19 
 
 		 399 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  39.57 
 
 		 388 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  44.29 
 
 		 418 aa  275  7e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  41.58 
 
 		 396 aa  275  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  43.9 
 
 		 407 aa  275  9e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  42.19 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  43.8 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  42.62 
 
 		 397 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  41.94 
 
 		 416 aa  272  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  41.46 
 
 		 396 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  41.92 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  42.55 
 
 		 392 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  42.97 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  42.03 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  40.97 
 
 		 400 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  40.54 
 
 		 403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  42.39 
 
 		 398 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  41.53 
 
 		 396 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  41.64 
 
 		 389 aa  265  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  41.13 
 
 		 392 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  40.16 
 
 		 415 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  43.49 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  41.3 
 
 		 469 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  39.89 
 
 		 389 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  40.37 
 
 		 395 aa  260  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  43.02 
 
 		 896 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  40.9 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  40.16 
 
 		 400 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  39.62 
 
 		 396 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  40.16 
 
 		 398 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  40.27 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  39.12 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  36.86 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  39.95 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  36.86 
 
 		 393 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  36.86 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  39.89 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  38.46 
 
 		 417 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  40.48 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  39.89 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2632  rhodanese domain protein/cystathionine beta-lyase  41.05 
 
 		 931 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0811484  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  37 
 
 		 394 aa  249  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  40.87 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  37.97 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  40.54 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  39.37 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  37.37 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  38.86 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  40.48 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  36.84 
 
 		 412 aa  245  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  42.08 
 
 		 388 aa  245  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  37.7 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  37.73 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  39.73 
 
 		 407 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  38.98 
 
 		 393 aa  243  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  38.11 
 
 		 388 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  37.43 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  39.12 
 
 		 398 aa  239  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  39.48 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  37.33 
 
 		 394 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  37.33 
 
 		 469 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  38.46 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  37.33 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>