More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2273 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  99.04 
 
 		 415 aa  830    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 415 aa  838    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  80.73 
 
 		 413 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  72.58 
 
 		 426 aa  618  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  74.88 
 
 		 422 aa  611  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  71.11 
 
 		 402 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  69.25 
 
 		 397 aa  556  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  62.84 
 
 		 397 aa  494  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  67.5 
 
 		 399 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  60.1 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  57.88 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  50.12 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  49.39 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  49.5 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  49.14 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  49.14 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  49.14 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  49.14 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  49.14 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  48.89 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  49.14 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  49.14 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  48.28 
 
 		 393 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  48.88 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  48.28 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  47.82 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  48.9 
 
 		 403 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  48.06 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  49.01 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  48.28 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  47.55 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  47.57 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  45.99 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  48.43 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  39.6 
 
 		 407 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  41.48 
 
 		 398 aa  272  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2139  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  39.18 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  38.52 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  38.69 
 
 		 407 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  39.76 
 
 		 388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  39.22 
 
 		 385 aa  252  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  37.41 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  39.55 
 
 		 388 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  40.25 
 
 		 469 aa  249  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  38 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  40.31 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  39.7 
 
 		 392 aa  247  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  41.41 
 
 		 418 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  42.41 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  39.01 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  40.53 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  38.23 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  39.85 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  38.5 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  38.52 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  38.24 
 
 		 396 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  38.92 
 
 		 388 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  36.46 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  39.43 
 
 		 410 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  37.62 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  39.01 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  37.47 
 
 		 389 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  38.21 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  38.82 
 
 		 393 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  36.75 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  38.13 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  38.99 
 
 		 395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  38.62 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  37 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  37.87 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  36.67 
 
 		 398 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  38.62 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  37.17 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  37.44 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  38.17 
 
 		 416 aa  230  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  36.14 
 
 		 396 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  36.5 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  38.48 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  36.91 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  37.56 
 
 		 388 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  37.17 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  38.52 
 
 		 896 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  37.17 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  36.32 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5109  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.47 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  38.15 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  34.65 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  32.35 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  32.35 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  36.8 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  32.35 
 
 		 393 aa  219  5e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  36.03 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3477  cystathionine beta-lyase  38.39 
 
 		 393 aa  219  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.489079 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  37.1 
 
 		 392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  34.12 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  32.43 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  32.43 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  32.43 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>