More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2139 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2139  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  100 
 
 		 396 aa  810    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  42.07 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  42.07 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  41.56 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  42.07 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  42.07 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  42.07 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  42.07 
 
 		 469 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  41.81 
 
 		 394 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  42.86 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  42.6 
 
 		 394 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  42.32 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  42.32 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  42.32 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  42.06 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  42.09 
 
 		 393 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  42.27 
 
 		 394 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  43.4 
 
 		 393 aa  279  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  41.16 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  41.9 
 
 		 397 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  42.4 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  40.63 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  41.69 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  40.32 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  39.84 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  39.12 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  39.95 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  39.18 
 
 		 415 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  41.69 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  39.85 
 
 		 403 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  41.01 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  38.48 
 
 		 413 aa  256  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.54 
 
 		 399 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  38.44 
 
 		 426 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  36.61 
 
 		 407 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.08 
 
 		 422 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  39.06 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  36.59 
 
 		 388 aa  220  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  35.95 
 
 		 416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  35.99 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  35.22 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  35.64 
 
 		 398 aa  212  9e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  32.15 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  33.88 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  36.1 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  32.97 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  36.36 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  34.62 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  35.95 
 
 		 469 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  35.99 
 
 		 398 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  36.96 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  33.33 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  35.48 
 
 		 398 aa  205  9e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  33.79 
 
 		 391 aa  205  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  32.87 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  34.14 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  33.6 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  33.87 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  34.95 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  33.33 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  33.33 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  36.34 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  34.1 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  35.42 
 
 		 393 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  33.6 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  33.52 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  34.64 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  34.7 
 
 		 401 aa  202  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  34.38 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  34.53 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  33.33 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  32.69 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  33.24 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  34.96 
 
 		 392 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  33.24 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  38.04 
 
 		 396 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  32.69 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  32.88 
 
 		 395 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  33.42 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  32.97 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  32.69 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  32.88 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  34.78 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  33.06 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  32.88 
 
 		 395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  33.06 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  32.88 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  32.88 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  32.88 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  32.88 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  33.15 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  34.25 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  32.88 
 
 		 395 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  32.34 
 
 		 389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  34.68 
 
 		 397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  31.59 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  32.42 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1495  cystathionine beta-lyase  33.75 
 
 		 385 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.627679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  35.44 
 
 		 431 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  31.64 
 
 		 395 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>