More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2056 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  100 
 
 		 399 aa  801    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  59.31 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  60.35 
 
 		 402 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  59.06 
 
 		 422 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  58.05 
 
 		 426 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  57.25 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  58.37 
 
 		 415 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  55.47 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  57.88 
 
 		 415 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  59.75 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  57.58 
 
 		 413 aa  428  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  47.3 
 
 		 469 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  47.3 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  47.3 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  47.3 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  47.3 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  47.3 
 
 		 394 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  46.67 
 
 		 394 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  47.04 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  48.68 
 
 		 400 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  48.56 
 
 		 417 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  44.91 
 
 		 394 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  46.7 
 
 		 403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  46.32 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  43.26 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  48.03 
 
 		 393 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  46.19 
 
 		 403 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  46.05 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  45.93 
 
 		 393 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  45.93 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  45.93 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  45.14 
 
 		 393 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  47.61 
 
 		 404 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  41.54 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  41.31 
 
 		 431 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2139  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  40.54 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  41.37 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  39.13 
 
 		 415 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  40.86 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  37.81 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  39.28 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  41.35 
 
 		 469 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  42.19 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  40.81 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  39.74 
 
 		 398 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  38.25 
 
 		 392 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  41.03 
 
 		 400 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  39.57 
 
 		 396 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  41.56 
 
 		 405 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  39.89 
 
 		 396 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  40.43 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  39.3 
 
 		 396 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  39.75 
 
 		 416 aa  236  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  36.99 
 
 		 389 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  34.33 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  40.75 
 
 		 388 aa  233  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  34.83 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  35.07 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  35.07 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  35.07 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  34.83 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  36.39 
 
 		 389 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  34.58 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  34.58 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  34.83 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  34.58 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  34.83 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  34.58 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  40 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  36.13 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  34.83 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  34.58 
 
 		 440 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  38.62 
 
 		 418 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  42.16 
 
 		 896 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  39.11 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  34.08 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  40.54 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  38.5 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  38.87 
 
 		 395 aa  225  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  39.52 
 
 		 397 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  37.84 
 
 		 412 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1131  cystathionine beta-lyase  42.18 
 
 		 396 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  38.52 
 
 		 395 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  34.73 
 
 		 396 aa  222  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  38.58 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  39.36 
 
 		 398 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  37.15 
 
 		 395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  39.63 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  37.56 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  36.76 
 
 		 392 aa  219  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  37.02 
 
 		 389 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  40.15 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  38.25 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  35.81 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  37.83 
 
 		 388 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  36.17 
 
 		 393 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  37.81 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5109  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  37.43 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360486 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  37.84 
 
 		 388 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>