More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2554 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 410 aa  816    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  59.21 
 
 		 398 aa  441  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  54.37 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  48.91 
 
 		 397 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  45.16 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  44.55 
 
 		 407 aa  331  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  43.53 
 
 		 401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  47.73 
 
 		 398 aa  326  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  47.03 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  43.07 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  43.24 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  43.92 
 
 		 411 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  44.79 
 
 		 398 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  46.44 
 
 		 398 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  45.48 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  43.07 
 
 		 396 aa  317  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  46.29 
 
 		 395 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  44.78 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  44.14 
 
 		 401 aa  316  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  46.29 
 
 		 395 aa  315  8e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  46.29 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  49.46 
 
 		 388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  43.42 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  44.17 
 
 		 418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  44.97 
 
 		 395 aa  313  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  42.65 
 
 		 395 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  46.89 
 
 		 469 aa  312  7.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  46.27 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  43.18 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 399 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  43.18 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  43.42 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  43.18 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  44.91 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  42.68 
 
 		 399 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  42.68 
 
 		 399 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  42.39 
 
 		 396 aa  309  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  46.86 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  43.73 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  47.04 
 
 		 388 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  46.32 
 
 		 393 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  44.12 
 
 		 395 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  45.62 
 
 		 388 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  45.27 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  42.42 
 
 		 396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  46.9 
 
 		 389 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  46.09 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  46.63 
 
 		 453 aa  302  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  45.55 
 
 		 397 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  44.47 
 
 		 392 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  45.72 
 
 		 396 aa  299  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  45.45 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  46.32 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  43.32 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  40.3 
 
 		 393 aa  297  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  40.3 
 
 		 393 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  44.95 
 
 		 392 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  40.3 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  45.11 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  45.14 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  44.02 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  45.82 
 
 		 405 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  46.17 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  46.17 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  46.17 
 
 		 394 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  46.17 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  46.17 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  46.17 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  46.17 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  45.38 
 
 		 394 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  44.27 
 
 		 388 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  40.1 
 
 		 389 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 		 395 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  41.65 
 
 		 395 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  44.24 
 
 		 400 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  41.4 
 
 		 395 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  43.42 
 
 		 412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  41.29 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  41.4 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  41.4 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  41.4 
 
 		 395 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  44.86 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  44.86 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  44.86 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  41.15 
 
 		 395 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  44.27 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  44.05 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  44.17 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  43.62 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 395 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  45.53 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  40.95 
 
 		 395 aa  279  6e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  41.21 
 
 		 395 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  43.39 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>