More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1908 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  97.77 
 
 		 403 aa  817    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  89.33 
 
 		 404 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 403 aa  832    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  72.49 
 
 		 417 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  71.43 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  63.73 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  63.8 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  62.18 
 
 		 394 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  61.87 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  62.03 
 
 		 469 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  61.87 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  61.87 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  61.87 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  61.87 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  61.87 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  61.87 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  61.6 
 
 		 394 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  60.82 
 
 		 393 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  60.82 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  60.57 
 
 		 394 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  60.82 
 
 		 393 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  61.56 
 
 		 393 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  60.57 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  48.35 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  50.25 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  47.14 
 
 		 407 aa  363  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  48.88 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  49.26 
 
 		 415 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  46.46 
 
 		 396 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  48.36 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  50.78 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  47.25 
 
 		 413 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  45.7 
 
 		 422 aa  341  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  45.37 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  46.19 
 
 		 399 aa  325  8.000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  45.82 
 
 		 388 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  49.86 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  45.62 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  48.35 
 
 		 385 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  45.9 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  42.82 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  46.09 
 
 		 395 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  46.05 
 
 		 396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  44.57 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  45.21 
 
 		 411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  45.48 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  44.23 
 
 		 401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  46.15 
 
 		 402 aa  302  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  44.17 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  44.17 
 
 		 395 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  44.92 
 
 		 388 aa  302  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  43.28 
 
 		 392 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  43.99 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  45.43 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  45.75 
 
 		 399 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  43 
 
 		 399 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  44.32 
 
 		 395 aa  299  6e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  44.41 
 
 		 398 aa  299  7e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  45.01 
 
 		 397 aa  299  7e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 389 aa  298  9e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  43.51 
 
 		 407 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  45.08 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  44.69 
 
 		 396 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  46.15 
 
 		 398 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  45.48 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  43.61 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  45.48 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  44.69 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  44.93 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  43.51 
 
 		 406 aa  295  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  42.19 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  44.77 
 
 		 395 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  45.17 
 
 		 396 aa  293  3e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  41.05 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  44.23 
 
 		 389 aa  293  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  43.72 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  43.44 
 
 		 399 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  41.05 
 
 		 393 aa  292  7e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  41.05 
 
 		 393 aa  292  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  44.66 
 
 		 399 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  44.51 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  43.87 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  43.17 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  43.44 
 
 		 399 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  44.23 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  42.9 
 
 		 395 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  43.18 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  43.63 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  44.93 
 
 		 400 aa  287  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  42.97 
 
 		 395 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  43.61 
 
 		 401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  44.38 
 
 		 418 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5774  cystathionine beta-lyase  42.03 
 
 		 407 aa  285  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000370329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  43.01 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  41.71 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  42.01 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  41.03 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  40.58 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>