More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2595 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  85.53 
 
 		 397 aa  694    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2595  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 396 aa  813    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2203  cystathionine beta-lyase  64.36 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1601  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  60.1 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2273  cystathionine beta-lyase  60.1 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302386  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2294  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  60.2 
 
 		 402 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.732113  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  58.45 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3021  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  59.41 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.238783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3409  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  57.55 
 
 		 426 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0443219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  59.9 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2056  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  55.47 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  50.13 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  48.97 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  50.26 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  48.72 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  48.47 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  47.94 
 
 		 394 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  47.68 
 
 		 393 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  47.94 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  48.97 
 
 		 393 aa  359  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  47.68 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  47.68 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  46.46 
 
 		 403 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  46.46 
 
 		 403 aa  356  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  48.2 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  46.6 
 
 		 417 aa  350  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  46.97 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  45.55 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 		 407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  41.79 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  41.03 
 
 		 415 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  41.81 
 
 		 407 aa  279  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  42.42 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  43.56 
 
 		 400 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2139  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  42.4 
 
 		 396 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.5463  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  41.31 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  42.47 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  41.94 
 
 		 388 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  38.86 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  41.37 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  39.07 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  38.6 
 
 		 412 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  39.13 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  40.55 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  41.07 
 
 		 418 aa  255  7e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  41.38 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  39.47 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  39.9 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  38.62 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  37.66 
 
 		 398 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  37.4 
 
 		 399 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  39.14 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  39.73 
 
 		 385 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  38.93 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  38.48 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  39.62 
 
 		 393 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  37.6 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  38.36 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  36.76 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  36.76 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  36.76 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  36.76 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  38.01 
 
 		 398 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  36.76 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  36.5 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  36.5 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  36.5 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  41.07 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  39.06 
 
 		 388 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  36.5 
 
 		 395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  37.72 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  38.13 
 
 		 388 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3161  cystathionine beta-lyase  40.7 
 
 		 896 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  38.35 
 
 		 416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  36.83 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  38.64 
 
 		 396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21510  Cystathionine beta-lyase  39.49 
 
 		 388 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  38.4 
 
 		 398 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  38.89 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  35.19 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  37.86 
 
 		 398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  35.18 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  34.94 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  36.22 
 
 		 403 aa  239  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  36.22 
 
 		 403 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  36.5 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  36.69 
 
 		 396 aa  239  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  36.22 
 
 		 403 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  35.52 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  38.12 
 
 		 396 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  35.52 
 
 		 395 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  35.52 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  37.53 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  35.52 
 
 		 395 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>