More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2626 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2626  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 431 aa  859    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3953  cystathionine beta-lyase  60.26 
 
 		 388 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.239618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2381  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  53.51 
 
 		 393 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2364  cystathionine beta-lyase  53.83 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0051  cystathionine beta-lyase  49.21 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  44.15 
 
 		 407 aa  338  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4431  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzymes  44.85 
 
 		 407 aa  326  6e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1355  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 417 aa  319  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1364  cystathionine beta-lyase  45.45 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0977  cystathionine beta-lyase  43.49 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.151377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  43.27 
 
 		 393 aa  310  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  43.01 
 
 		 393 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  43.01 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  45.45 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  42.38 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2263  cystathionine beta-lyase  43.88 
 
 		 394 aa  300  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  44.78 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  44.13 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  42.78 
 
 		 395 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2158  cystathionine beta-lyase  43.35 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2323  cystathionine beta-lyase  43.35 
 
 		 469 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1314  cystathionine beta-lyase  43.35 
 
 		 394 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.539265  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0093  cystathionine beta-lyase  43.35 
 
 		 394 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0919845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1074  cystathionine beta-lyase  43.35 
 
 		 394 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.330855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2195  cystathionine beta-lyase  43.35 
 
 		 394 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.681005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1803  cystathionine beta-lyase  43.35 
 
 		 394 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1908  cystathionine beta-lyase  42.93 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  0.123888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1579  cystathionine beta-lyase  42.31 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55911  normal  0.0365901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  44.65 
 
 		 397 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  44.53 
 
 		 469 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2333  cystathionine beta-lyase  41.51 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0136858  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  42.71 
 
 		 398 aa  292  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 399 aa  292  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  42.71 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  43.77 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  42.43 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  42.41 
 
 		 453 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  43.31 
 
 		 396 aa  288  9e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  41.62 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  44.09 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1804  cystathionine beta-lyase  42.02 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525614  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  39.7 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  42.03 
 
 		 399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6300  cystathionine beta-lyase  42.02 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0676411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1779  cystathionine beta-lyase  42.02 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.073008  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  41.31 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  43.58 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  44.02 
 
 		 398 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  43.6 
 
 		 399 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  43.83 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  48.6 
 
 		 398 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  44.12 
 
 		 398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  40.55 
 
 		 411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1491  cystathionine beta-lyase  43.35 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278977  normal  0.102915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  43.83 
 
 		 396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1719  cystathionine beta-lyase  40.96 
 
 		 394 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  43.98 
 
 		 388 aa  282  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  43.11 
 
 		 392 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  46.22 
 
 		 400 aa  281  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  40.57 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1691  cystathionine beta-lyase  40.78 
 
 		 394 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  43.04 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  40.81 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  40.81 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  37.38 
 
 		 407 aa  279  9e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  39.94 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  40.27 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1885  cystathionine beta-lyase  40.41 
 
 		 397 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.569163  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  39.73 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  40.41 
 
 		 389 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  41.26 
 
 		 388 aa  276  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1639  cystathionine beta-lyase  43.38 
 
 		 404 aa  276  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.772657  normal  0.209412 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 395 aa  275  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1615  cystathionine beta-lyase  42.63 
 
 		 399 aa  275  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.566516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5078  cystathionine beta-lyase  40.62 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  41.65 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  40.83 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  40.71 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  40.27 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  39.85 
 
 		 393 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  41.69 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  42.35 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  39.72 
 
 		 401 aa  272  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  43.54 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  39.73 
 
 		 399 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  42.08 
 
 		 440 aa  272  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  42.08 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  42.08 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4038  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent protein  40.82 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707403  normal  0.111476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  44.24 
 
 		 418 aa  272  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  39.58 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  41.85 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  40.28 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  39.73 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  42.08 
 
 		 395 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  42.97 
 
 		 395 aa  270  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  41.69 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>