More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0683 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2120  cystathionine beta-lyase  83.85 
 
 		 391 aa  702    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0806136  normal  0.0524634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1838  cystathionine beta-lyase  80.72 
 
 		 399 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2191  cystathionine beta-lyase  80.36 
 
 		 399 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2452  cystathionine beta-lyase  80.98 
 
 		 399 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1873  cystathionine beta-lyase  80.98 
 
 		 399 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0608002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1736  cystathionine beta-lyase  80.76 
 
 		 399 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2520  cystathionine beta-lyase  81.48 
 
 		 406 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2204  cystathionine beta-lyase  80.36 
 
 		 399 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2281  cystathionine beta-lyase  81.14 
 
 		 399 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1621  cystathionine beta-lyase  80.05 
 
 		 396 aa  657    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1825  cystathionine beta-lyase  80.72 
 
 		 399 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.255058  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2496  cystathionine beta-lyase  84.18 
 
 		 411 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.654385  normal  0.454177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2414  cystathionine beta-lyase  81.14 
 
 		 399 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2008  cystathionine beta-lyase  78.57 
 
 		 401 aa  654    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1789  cystathionine beta-lyase  81.28 
 
 		 395 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0834486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0683  cystathionine beta-lyase  100 
 
 		 407 aa  849    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.36556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2313  cystathionine beta-lyase  75.26 
 
 		 395 aa  622  1e-177  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2274  cystathionine beta-lyase  64.96 
 
 		 393 aa  557  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003805  cystathionine beta-lyase  64.6 
 
 		 402 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.227747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02695  cystathionine beta-lyase  64.34 
 
 		 401 aa  541  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1276  cystathionine beta-lyase  64.36 
 
 		 396 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1355  cystathionine beta-lyase  61.73 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.795173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0384  cystathionine beta-lyase  56.78 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.782628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0341  cystathionine beta-lyase  55.5 
 
 		 396 aa  454  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3762  cystathionine beta-lyase  55.36 
 
 		 397 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0269  cystathionine beta-lyase  53.83 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3599  cystathionine beta-lyase  55.78 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0671  cystathionine beta-lyase  53.83 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4212  cystathionine beta-lyase  53.2 
 
 		 398 aa  441  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0590  cystathionine beta-lyase  53.83 
 
 		 403 aa  443  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3776  cystathionine beta-lyase  55.75 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.968608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2557  cystathionine beta-lyase  53.18 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02881  cystathionine beta-lyase  51.28 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0691  cystathionine beta-lyase  51.28 
 
 		 395 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4318  cystathionine beta-lyase  50.74 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0688  cystathionine beta-lyase  51.28 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3186  cystathionine beta-lyase  51.28 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02831  hypothetical protein  51.28 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3476  cystathionine beta-lyase  51.28 
 
 		 395 aa  428  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2072  cystathionine beta-lyase  53.08 
 
 		 398 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.23598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3292  cystathionine beta-lyase  51.53 
 
 		 395 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3435  cystathionine beta-lyase  51.02 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2913  cystathionine beta-lyase  52.17 
 
 		 398 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3418  cystathionine beta-lyase  51.29 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3344  cystathionine beta-lyase  51.03 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.725487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3409  cystathionine beta-lyase  51.28 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3510  cystathionine beta-lyase  51.03 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3335  cystathionine beta-lyase  51.28 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2548  cystathionine beta-lyase  51.52 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0555491  normal  0.497435 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0540  cystathionine beta-lyase  51.4 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.144132  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3415  cystathionine beta-lyase  51.03 
 
 		 395 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0475  cystathionine beta-lyase  52.21 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.715777  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1530  cystathionine beta-lyase  52.56 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.996123  normal  0.331074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2831  cystathionine beta-lyase  50.91 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.735299  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2983  cystathionine beta-lyase  51.79 
 
 		 385 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475829 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3922  cystathionine beta-lyase  50.9 
 
 		 397 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380432  normal  0.700779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3059  cystathionine beta-lyase  50.38 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4545  cystathionine beta-lyase  49.74 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6376  cystathionine beta-lyase  46.92 
 
 		 395 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0739  cystathionine beta-lyase  52.46 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5869  cystathionine beta-lyase  46.15 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3581  cystathionine beta-lyase  46.94 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2559  cystathionine beta-lyase  50.92 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0643233  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0734  cystathionine beta-lyase  52.19 
 
 		 453 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1604  cystathionine beta-lyase  46.13 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230939  normal  0.665225 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0833  cystathionine beta-lyase  48.33 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1109  cystathionine beta-lyase  48.45 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3806  cystathionine beta-lyase  48.83 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1613  cystathionine beta-lyase  48.73 
 
 		 392 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0645  cystathionine beta-lyase  49.09 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.186221 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5482  cystathionine beta-lyase  48.96 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3894  cystathionine beta-lyase  48.83 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4265  cystathionine beta-lyase  47.84 
 
 		 389 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4775  cystathionine beta-lyase  47.91 
 
 		 397 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4251  cystathionine beta-lyase  47.76 
 
 		 395 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344973  hitchhiker  0.00449995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1112  cystathionine beta-lyase  48.95 
 
 		 388 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2549  cystathionine beta-lyase  47 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2165  cystathionine beta-lyase  44.68 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1053  cystathionine beta-lyase  45.92 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4772  cystathionine beta-lyase  44.65 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1707  cystathionine beta-lyase  46.79 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.442893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4622  cystathionine beta-lyase  44.91 
 
 		 395 aa  359  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1564  cystathionine beta-lyase  46.13 
 
 		 396 aa  359  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.346306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4252  cystathionine beta-lyase  44.91 
 
 		 395 aa  359  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.288901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1761  cystathionine beta-lyase  46.13 
 
 		 396 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.353081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2264  cystathionine beta-lyase  46.91 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.455669  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3588  cystathionine beta-lyase  43.7 
 
 		 388 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3629  cystathionine beta-lyase  44.04 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3976  cystathionine beta-lyase  44.13 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0701  cystathionine beta-lyase  41.37 
 
 		 388 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2554  cystathionine beta-lyase  44.55 
 
 		 410 aa  325  7e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61873  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0607  cystathionine beta-lyase  41.84 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.952184  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0194  cystathionine beta-lyase  44.89 
 
 		 416 aa  322  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212161  normal  0.190528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4134  cystathionine beta-lyase  42.56 
 
 		 400 aa  322  9.000000000000001e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.565823  normal  0.0393271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2039  cystathionine beta-lyase  43.46 
 
 		 412 aa  319  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482108  normal  0.0466473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2926  cystathionine beta-lyase  43.11 
 
 		 388 aa  315  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.871498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0278  cystathionine beta-lyase  40.92 
 
 		 405 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2413  cystathionine beta-lyase  41.54 
 
 		 415 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.190027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1852  cystathionine beta-lyase  43.17 
 
 		 394 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.133902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1980  cystathionine beta-lyase  44.66 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.865383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>